RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.78■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.76■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 IL27Q8NEV9 243 aa21.76■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.74■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 NLRP13Q86W25 1043 aa21.74■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 MYOM1P52179 1685 aa21.74■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 GSE1Q14687 1217 aa21.71■■□□□ 1.07
SYP-208ENST00000494396 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.69■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.69■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 ALKQ9UM73 1620 aa21.69■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.68■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 NLRP1Q9C000 1473 aa21.67■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 C3P01024 1663 aa21.65■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 STK26Q9P289 416 aa21.65■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SYP-208ENST00000494396 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.64■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.64■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.63■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 EVC2Q86UK5 1308 aa21.61■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 PTPRMP28827 1452 aa21.6■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 NFKBIBQ15653 356 aa21.59■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYP-208ENST00000494396 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.58■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 PRAM1Q96QH2 718 aa21.57■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 POGKQ9P215 609 aa21.57■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.56■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.56■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.56■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.55■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 DLC1Q96QB1 1528 aa21.55■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.54■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 ABCC11Q96J66 1382 aa21.53■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 FAM161AQ3B820 660 aa21.52■■□□□ 1.04
SYP-208ENST00000494396 PPP2R1AP30153 589 aa21.51■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 EID1Q9Y6B2 187 aa21.51■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 METP08581 1390 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 CRBNQ96SW2 442 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.5■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 SLIT1O75093 1534 aa21.49■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.49■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.49■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 LTKP29376 864 aa21.49■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 CABP2Q9NPB3 220 aa21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.48■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.47■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.46■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.46■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.46■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.46■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SYP-208ENST00000494396 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.45■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 TECPR2O15040 1411 aa21.45■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 SIRT1Q96EB6 747 aa21.44■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.44■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.44■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 CDK19Q9BWU1 502 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 C8orf34Q49A92 452 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 CPS1P31327 1500 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 USP32Q8NFA0 1604 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 MED14O60244 1454 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 PLIN1O60240 522 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-208ENST00000494396 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-208ENST00000494396 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-208ENST00000494396 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
SYP-208ENST00000494396 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-208ENST00000494396 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-208ENST00000494396 TBX22Q9Y458 520 aa21.36■■□□□ 1.01
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