RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493200.5

PLXDC1-208, Transcript of plexin domain containing 1, human

TSL 2

Gene PLXDC1, Length 2,602 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXDC1-208	ENST00000493200	NUP155	O75694	1391 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	PZP	P20742	1482 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	C14orf37	Q86TY3	774 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	TSC1	Q92574	1164 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PLXDC1-208	ENST00000493200	PKD2	Q13563	968 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	PANK3	Q9H999	370 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.71	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	KDM5C	P41229	1560 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	UNC13B	O14795	1591 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	KCNJ4	P48050	445 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	KIF3B	O15066	747 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	A2M	P01023	1474 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLXDC1-208	ENST00000493200	KANK1	Q14678	1352 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	IGHD	P01880	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.55
PLXDC1-208	ENST00000493200	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.58	□□□□□ -0.56
PLXDC1-208	ENST00000493200	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PLXDC1-208	ENST00000493200	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PLXDC1-208	ENST00000493200	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PLXDC1-208	ENST00000493200	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PLXDC1-208	ENST00000493200	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PLXDC1-208	ENST00000493200	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		11.57	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms