RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SIRT1Q96EB6 747 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYOM2P54296 1465 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STK26Q9P289 416 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AFF2P51816 1311 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PXDNQ92626 1479 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RXRBP28702 533 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FOXO3O43524 673 aa22■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ADGRB1O14514 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STAC3Q96MF2 364 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C8orf37Q96NL8 207 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DLC1Q96QB1 1528 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUTM2FA1L443 756 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ADAMTS2O95450 1211 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRAM1Q96QH2 718 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-214ENST00000492897 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NGLY1Q96IV0 654 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGS12O14924 1447 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP21Q9UK80 565 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIF1AQ12756 1690 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ADGRB2O60241 1585 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 POGKQ9P215 609 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ATRNO75882 1429 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SBNO1A3KN83 1393 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP32Q8NFA0 1604 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PSME1Q06323 249 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLIT2O94813 1529 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARHGEF10O15013 1369 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EP400Q96L91 3159 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ATP7BP35670 1465 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM83GA6ND36 823 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GLI3P10071 1580 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VPS72Q15906 364 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDK19Q9BWU1 502 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ALS2Q96Q42 1657 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABCA3Q99758 1704 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms