RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TOM1-216ENST00000492723 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TOM1-216ENST00000492723 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.27■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 MORC1Q86VD1 984 aa22.26■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.25■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.25■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.24■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.23■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 TNRQ92752 1358 aa22.23■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 USP32Q8NFA0 1604 aa22.22■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
TOM1-216ENST00000492723 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.19■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.19■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.19■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.18■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PP64 1363 aa22.17■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.17■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 CDK19Q9BWU1 502 aa22.17■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.16■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.16■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.15■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 DLC1Q96QB1 1528 aa22.15■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 NSD2O96028 1365 aa22.15■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TOM1-216ENST00000492723 ABCC11Q96J66 1382 aa22.14■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.14■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 METP08581 1390 aa22.13■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.12■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 APAF1O14727 1248 aa22.11■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 MTHFSP49914 203 aa22.11■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.11■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 ZNF521Q96K83 1311 aa22.1■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 CABP1Q9NZU7 370 aa22.09■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA2Q08379 1002 aa22.08■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.08■■□□□ 1.13
TOM1-216ENST00000492723 CFAP53Q96M91 514 aa22.08■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.07■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.07■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 SHPRHQ149N8 1683 aa22.07■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 NLRP1Q9C000 1473 aa22.06■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.05■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 FYB1O15117 783 aa22.04■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.03■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 C3P01024 1663 aa22.02■■□□□ 1.12
TOM1-216ENST00000492723 LTKP29376 864 aa22.01■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 SLFN5Q08AF3 891 aa22.01■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 MYT1Q01538 1121 aa22.01■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 NGEFQ8N5V2 710 aa22.01■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 TECPR2O15040 1411 aa22.01■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.01■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 KNDC1Q76NI1 1749 aa22■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 RUNDC1Q96C34 613 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 SIRT1Q96EB6 747 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 PLIN1O60240 522 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 MED14O60244 1454 aa21.99■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 ATP7BP35670 1465 aa21.98■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 CPS1P31327 1500 aa21.98■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.98■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 EID1Q9Y6B2 187 aa21.97■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.96■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 NEUROD2Q15784 382 aa21.95■■□□□ 1.11
TOM1-216ENST00000492723 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.95■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 E9PSI1 815 aa21.95■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.95■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 WWC1Q8IX03 1113 aa21.94■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.94■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.94■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.94■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.92■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.91■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.91■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 SLIT1O75093 1534 aa21.9■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.89■■□□□ 1.1
TOM1-216ENST00000492723 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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