RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGGTB-212ENST00000491266 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-212ENST00000491266 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-212ENST00000491266 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.71□□□□□ -0.86
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RABGGTB-212ENST00000491266 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-212ENST00000491266 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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RABGGTB-212ENST00000491266 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-212ENST00000491266 FMN1Q68DA7 1419 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCA8O94911 1581 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF11O15085 1522 aa9.62□□□□□ -0.87
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RABGGTB-212ENST00000491266 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 SULF1Q8IWU6 871 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 UACAQ9BZF9 1416 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 NBPF3Q9H094 633 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-212ENST00000491266 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTB-212ENST00000491266 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.57□□□□□ -0.88
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RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-212ENST00000491266 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCC2Q92887 1545 aa9.56□□□□□ -0.88
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RABGGTB-212ENST00000491266 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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RABGGTB-212ENST00000491266 SLF2Q8IX21 1173 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 RDH13Q8NBN7 331 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.51□□□□□ -0.89
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RABGGTB-212ENST00000491266 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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RABGGTB-212ENST00000491266 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.49□□□□□ -0.89
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RABGGTB-212ENST00000491266 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-212ENST00000491266 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.47□□□□□ -0.89
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