RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRN-217ENST00000489650 STK26Q9P289 416 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRN-217ENST00000489650 USP21Q9UK80 565 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRN-217ENST00000489650 NUTM2FA1L443 756 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 FOXO3O43524 673 aa27.64■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.64■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.64■■■□□ 2.02
PTPRN-217ENST00000489650 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 PXDNQ92626 1479 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRN-217ENST00000489650 IFT172Q9UG01 1749 aa27.59■■■□□ 2.01
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PTPRN-217ENST00000489650 ATRNO75882 1429 aa27.57■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.56■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.55■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 TECPR2O15040 1411 aa27.55■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 ABCC11Q96J66 1382 aa27.54■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.52■■■□□ 2
PTPRN-217ENST00000489650 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.52■■■□□ 2
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PTPRN-217ENST00000489650 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRN-217ENST00000489650 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PTPRN-217ENST00000489650 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PTPRN-217ENST00000489650 EP400Q96L91 3159 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRN-217ENST00000489650 PLEKHG5O94827 1062 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 KIF1AQ12756 1690 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 SIRT1Q96EB6 747 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PTPRN-217ENST00000489650 PRAM1Q96QH2 718 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 SLIT2O94813 1529 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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PTPRN-217ENST00000489650 PSME1Q06323 249 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 USP32Q8NFA0 1604 aa27.35■■□□□ 1.97
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PTPRN-217ENST00000489650 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.35■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC125Q86Z20 511 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-217ENST00000489650 POGKQ9P215 609 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 SBNO1A3KN83 1393 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-217ENST00000489650 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 VPS72Q15906 364 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 ABCA3Q99758 1704 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 DLC1Q96QB1 1528 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 FAM83GA6ND36 823 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGEF10O15013 1369 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-217ENST00000489650 ADGRB1O14514 1584 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 ADGRB2O60241 1585 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0G2JS52 829 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 MYT1Q01538 1121 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 BTG4Q9NY30 223 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-217ENST00000489650 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 ALS2Q96Q42 1657 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 NRAPQ86VF7 1730 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-217ENST00000489650 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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