RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
EHD1-211ENST00000489379 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.19■■■■□ 3.22
EHD1-211ENST00000489379 JCADQ9P266 1359 aa35.19■■■■□ 3.22
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.19■■■■□ 3.22
EHD1-211ENST00000489379 PRAM1Q96QH2 718 aa35.15■■■■□ 3.22
EHD1-211ENST00000489379 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.15■■■■□ 3.22
EHD1-211ENST00000489379 POGKQ9P215 609 aa35.15■■■■□ 3.22
EHD1-211ENST00000489379 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.12■■■■□ 3.21
EHD1-211ENST00000489379 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.11■■■■□ 3.21
EHD1-211ENST00000489379 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.11■■■■□ 3.21
EHD1-211ENST00000489379 NEUROD1Q13562 356 aa35.1■■■■□ 3.21
EHD1-211ENST00000489379 SHPRHQ149N8 1683 aa35.08■■■■□ 3.21
EHD1-211ENST00000489379 ORAI2Q96SN7 254 aa35.08■■■■□ 3.21
EHD1-211ENST00000489379 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.06■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 ADGRB2O60241 1585 aa35.04■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.04■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
EHD1-211ENST00000489379 NPHP3Q7Z494 1330 aa35■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 KIF1AQ12756 1690 aa34.98■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 NUTM2FA1L443 756 aa34.96■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.96■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.96■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
EHD1-211ENST00000489379 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.92■■■■□ 3.18
EHD1-211ENST00000489379 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
EHD1-211ENST00000489379 TONSLQ96HA7 1378 aa34.91■■■■□ 3.18
EHD1-211ENST00000489379 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
EHD1-211ENST00000489379 FOXO3O43524 673 aa34.89■■■■□ 3.18
EHD1-211ENST00000489379 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.88■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.88■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 ILDR2Q71H61 639 aa34.87■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 PXDNQ92626 1479 aa34.86■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.86■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 USP32Q8NFA0 1604 aa34.84■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.83■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 LRP6O75581 1613 aa34.83■■■■□ 3.17
EHD1-211ENST00000489379 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 PSME1Q06323 249 aa34.79■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.79■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 ITSN1Q15811 1721 aa34.78■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.77■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.76■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.76■■■■□ 3.16
EHD1-211ENST00000489379 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.75■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 CDK19Q9BWU1 502 aa34.74■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.73■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.73■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.71■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 SBNO1A3KN83 1393 aa34.71■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 ATP7BP35670 1465 aa34.71■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
EHD1-211ENST00000489379 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.69■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.66■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.66■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.66■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 SOCS7O14512 581 aa34.64■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.64■■■■□ 3.14
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF10O15013 1369 aa34.63■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 POTEAQ6S8J7 498 aa34.63■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.63■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 EVC2Q86UK5 1308 aa34.6■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 ADAMTS2O95450 1211 aa34.59■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 C8orf37Q96NL8 207 aa34.59■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 AFF2P51816 1311 aa34.58■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.58■■■■□ 3.13
EHD1-211ENST00000489379 NGLY1Q96IV0 654 aa34.57■■■■□ 3.12
EHD1-211ENST00000489379 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
EHD1-211ENST00000489379 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.56■■■■□ 3.12
EHD1-211ENST00000489379 ALS2Q96Q42 1657 aa34.54■■■■□ 3.12
EHD1-211ENST00000489379 CABP2Q9NPB3 220 aa34.53■■■■□ 3.12
EHD1-211ENST00000489379 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.52■■■■□ 3.12
EHD1-211ENST00000489379 ACEP12821 1306 aa34.51■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.5■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 ABCA3Q99758 1704 aa34.45■■■■□ 3.11
EHD1-211ENST00000489379 SLC24A1O60721 1099 aa34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms