RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 NEURL4Q96JN8 1562 aa17.32■□□□□ 0.36
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NISCH-212ENST00000488380 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 ADGRB3O60242 1522 aa17.31■□□□□ 0.36
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NISCH-212ENST00000488380 GOLGA2Q08379 1002 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 BECN1Q14457 450 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZMYND15Q9H091 742 aa17.3■□□□□ 0.36
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NISCH-212ENST00000488380 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 LMTK2Q8IWU2 1503 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.29■□□□□ 0.36
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NISCH-212ENST00000488380 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
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NISCH-212ENST00000488380 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
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NISCH-212ENST00000488380 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
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NISCH-212ENST00000488380 E9PSI1 815 aa17.14■□□□□ 0.33
NISCH-212ENST00000488380 MTHFSP49914 203 aa17.14■□□□□ 0.33
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NISCH-212ENST00000488380 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.14■□□□□ 0.33
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NISCH-212ENST00000488380 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-212ENST00000488380 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-212ENST00000488380 COG6Q9Y2V7 657 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-212ENST00000488380 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.11■□□□□ 0.33
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NISCH-212ENST00000488380 RICTORQ6R327 1708 aa17.08■□□□□ 0.33
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NISCH-212ENST00000488380 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.08■□□□□ 0.32
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NISCH-212ENST00000488380 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 FSD2A1L4K1 749 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 ESPNB1AK53 854 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 MRE11P49959 708 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PP64 1363 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-212ENST00000488380 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.04■□□□□ 0.32
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