RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487774.1

C7orf49-211, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C7orf49, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-211ENST00000487774 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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C7orf49-211ENST00000487774 ITGAEP38570 1179 aa29.15■■■□□ 2.26
C7orf49-211ENST00000487774 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.15■■■□□ 2.26
C7orf49-211ENST00000487774 HFM1A2PYH4 1435 aa29.14■■■□□ 2.26
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C7orf49-211ENST00000487774 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.12■■■□□ 2.25
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C7orf49-211ENST00000487774 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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C7orf49-211ENST00000487774 FOXO3O43524 673 aa29.08■■■□□ 2.25
C7orf49-211ENST00000487774 SLIT2O94813 1529 aa29.07■■■□□ 2.24
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C7orf49-211ENST00000487774 LRP5O75197 1615 aa29.05■■■□□ 2.24
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C7orf49-211ENST00000487774 USP32Q8NFA0 1604 aa28.97■■■□□ 2.23
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C7orf49-211ENST00000487774 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.96■■■□□ 2.23
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C7orf49-211ENST00000487774 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.93■■■□□ 2.22
C7orf49-211ENST00000487774 TECPR2O15040 1411 aa28.92■■■□□ 2.22
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C7orf49-211ENST00000487774 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.89■■■□□ 2.22
C7orf49-211ENST00000487774 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.89■■■□□ 2.22
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C7orf49-211ENST00000487774 KIF1AQ12756 1690 aa28.89■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.88■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.87■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 STK26Q9P289 416 aa28.87■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.86■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.86■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.86■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.86■■■□□ 2.21
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C7orf49-211ENST00000487774 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.84■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.83■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.83■■■□□ 2.21
C7orf49-211ENST00000487774 ABCC11Q96J66 1382 aa28.82■■■□□ 2.2
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C7orf49-211ENST00000487774 NRAPQ86VF7 1730 aa28.73■■■□□ 2.19
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C7orf49-211ENST00000487774 ARHGEF10O15013 1369 aa28.69■■■□□ 2.18
C7orf49-211ENST00000487774 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.69■■■□□ 2.18
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C7orf49-211ENST00000487774 DISP2A7MBM2 1401 aa28.64■■■□□ 2.18
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C7orf49-211ENST00000487774 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
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C7orf49-211ENST00000487774 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.57■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.57■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 ALS2Q96Q42 1657 aa28.55■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.54■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 PRAM1Q96QH2 718 aa28.54■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.52■■■□□ 2.16
C7orf49-211ENST00000487774 ADGRB2O60241 1585 aa28.51■■■□□ 2.15
C7orf49-211ENST00000487774 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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