RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486660.1

STX4-209, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-209ENST00000486660 LRP5O75197 1615 aa21.78■■□□□ 1.08
STX4-209ENST00000486660 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.78■■□□□ 1.08
STX4-209ENST00000486660 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
STX4-209ENST00000486660 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
STX4-209ENST00000486660 CLTCL1P53675 1640 aa21.77■■□□□ 1.08
STX4-209ENST00000486660 GLI3P10071 1580 aa21.77■■□□□ 1.08
STX4-209ENST00000486660 ROCK1Q13464 1354 aa21.75■■□□□ 1.07
STX4-209ENST00000486660 PXDNQ92626 1479 aa21.75■■□□□ 1.07
STX4-209ENST00000486660 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
STX4-209ENST00000486660 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.73■■□□□ 1.07
STX4-209ENST00000486660 KIF1BO60333 1816 aa21.72■■□□□ 1.07
STX4-209ENST00000486660 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.7■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.7■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.68■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 SLIT2O94813 1529 aa21.68■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.67■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 FOXO3O43524 673 aa21.67■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.66■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 HFM1A2PYH4 1435 aa21.65■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 ITGAEP38570 1179 aa21.65■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
STX4-209ENST00000486660 USP32Q8NFA0 1604 aa21.63■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.63■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 NUTM2FA1L443 756 aa21.62■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.6■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 HRCP23327 699 aa21.6■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 PPLO60437 1756 aa21.59■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 NAIPQ13075 1403 aa21.58■■□□□ 1.05
STX4-209ENST00000486660 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.56■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.56■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.55■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 PLEKHG5O94827 1062 aa21.54■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 VPS72Q15906 364 aa21.54■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.54■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 ABCA3Q99758 1704 aa21.53■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.53■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 KIF1AQ12756 1690 aa21.53■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 BAG6P46379 1132 aa21.52■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.52■■□□□ 1.04
STX4-209ENST00000486660 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.5■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.5■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 STK26Q9P289 416 aa21.5■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.49■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.48■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 A0A0G2JS52 829 aa21.48■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 MYT1Q01538 1121 aa21.48■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.48■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.47■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 NRAPQ86VF7 1730 aa21.46■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 TECPR2O15040 1411 aa21.46■■□□□ 1.03
STX4-209ENST00000486660 FAM182BQ5T319 152 aa21.45■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.45■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 IFT172Q9UG01 1749 aa21.45■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.44■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 FAM83GA6ND36 823 aa21.42■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.41■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.4■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
STX4-209ENST00000486660 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.39■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 ABCC11Q96J66 1382 aa21.38■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 PSME1Q06323 249 aa21.38■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 YY1P25490 414 aa21.37■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 BTG4Q9NY30 223 aa21.36■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.36■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 DISP2A7MBM2 1401 aa21.36■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 SBNO1A3KN83 1393 aa21.36■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 ARHGEF10O15013 1369 aa21.35■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.34■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
STX4-209ENST00000486660 RGL3Q3MIN7 710 aa21.32■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.3■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 ADGRB2O60241 1585 aa21.3■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.29■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.29■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 PIK3C2GO75747 1445 aa21.29■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 ALS2Q96Q42 1657 aa21.29■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.29■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 TRIM37O94972 964 aa21.28■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 RREB1Q92766 1687 aa21.28■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.27■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.27■■□□□ 1
STX4-209ENST00000486660 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.26■□□□□ 0.99
STX4-209ENST00000486660 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
STX4-209ENST00000486660 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms