RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.28□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.27□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATRNO75882 1429 aa9.27□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.26□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BRINP3Q76B58 766 aa9.26□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.26□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRPC6Q9Y210 931 aa9.26□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.25□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MBD5Q9P267 1494 aa9.25□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 STK25O00506 426 aa9.24□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PSEN1P49768 467 aa9.24□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP21Q9UK80 565 aa9.24□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.23□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C1QTNF8P60827 252 aa9.23□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.23□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UNC13BO14795 1591 aa9.23□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADAMTS2O95450 1211 aa9.21□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLCN6P51797 869 aa9.21□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PIK3C2BO00750 1634 aa9.2□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.2□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 STK24Q9Y6E0 443 aa9.2□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.2□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATF3P18847 181 aa9.19□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GABBR2O75899 941 aa9.18□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PLCB2Q00722 1185 aa9.18□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PTCH1Q13635 1447 aa9.18□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.18□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DCCP43146 1447 aa9.17□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.17□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C14orf37Q86TY3 774 aa9.17□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.16□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TIE1P35590 1138 aa9.16□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MST1RQ04912 1400 aa9.15□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.15□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.15□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.14□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BAG6P46379 1132 aa9.14□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.14□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.13□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GLI3P10071 1580 aa9.13□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.13□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CEP152O94986 1710 aa9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CABP2Q9NPB3 220 aa9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EEA1Q15075 1411 aa9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.11□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADGRB3O60242 1522 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MYOM2P54296 1465 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LAMC1P11047 1609 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC34A2O95436 690 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IDI1Q13907 227 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BCANQ96GW7 911 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TBX22Q9Y458 520 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZFYVE9O95405 1425 aa9.1□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DISP2A7MBM2 1401 aa9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MFRPQ9BY79 579 aa9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PIK3R4Q99570 1358 aa9.09□□□□□ -0.95
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC24A1O60721 1099 aa9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CFAP44Q96MT7 982 aa9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.08□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.07□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRPM2O94759 1503 aa9.07□□□□□ -0.96
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms