RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483597.1

TLE4-222, Transcript of transducin like enhancer of split 4, human

TSL 5

Gene TLE4, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE4-222	ENST00000483597	ATF3	P18847	181 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	POGK	Q9P215	609 aa		13	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TLE4-222	ENST00000483597	SLC24A1	O60721	1099 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	PIP4K2B	P78356	416 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	MST1R	Q04912	1400 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	ADGRB2	O60241	1585 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	BRINP3	Q76B58	766 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TLE4-222	ENST00000483597	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	CDK19	Q9BWU1	502 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	HSPA1L	P34931	641 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	USP47	Q96K76	1375 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	TESK2	Q96S53	571 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TLE4-222	ENST00000483597	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	NUTM2F	A1L443	756 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	FOXO3	O43524	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	USP32	Q8NFA0	1604 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	PSME1	Q06323	249 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	CDCA8	Q53HL2	280 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	CABP2	Q9NPB3	220 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	ATP7B	P35670	1465 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	TMF1	P82094	1093 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	PHLPP1	O60346	1717 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	ITSN1	Q15811	1721 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	JCAD	Q9P266	1359 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE4-222	ENST00000483597	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	CABP1	Q9NZU7	370 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	ACE	P12821	1306 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	PXDN	Q92626	1479 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	SHPRH	Q149N8	1683 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TLE4-222	ENST00000483597	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TLE4-222	ENST00000483597	TMC1	Q8TDI8	760 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TLE4-222	ENST00000483597	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		12.7	□□□□□ -0.38

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