RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 GMPRP36959 345 aa9.71□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM32Q13049 653 aa9.71□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 MSS51Q4VC12 460 aa9.71□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 BRICD5Q6PL45 260 aa9.71□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 RDH13Q8NBN7 331 aa9.68□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.66□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 FECHP22830 423 aa9.65□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.65□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 IRF7Q92985 503 aa9.65□□□□□ -0.86
ANKRD28-210ENST00000479043 GCGRP47871 477 aa9.64□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 MMP16P51512 607 aa9.64□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.63□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 CFAP44Q96MT7 982 aa9.63□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.62□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 H3BM21 787 aa9.6□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 SKOR1P84550 965 aa9.6□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 HIC1Q14526 733 aa9.6□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ANKRD28-210ENST00000479043 ERBB4Q15303 1308 aa9.58□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 VEGFBP49765 207 aa9.58□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.58□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 WNT7BP56706 349 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 SULF1Q8IWU6 871 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 BMP1P13497 986 aa9.56□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 ALDH1A1P00352 501 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 Q3C1V9 767 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 NLRP7Q8WX94 980 aa9.55□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.54□□□□□ -0.88
ANKRD28-210ENST00000479043 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 PHOX2BQ99453 314 aa9.51□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 SEMA3EO15041 775 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 GNPATO15228 680 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 SIAH2O43255 324 aa9.5□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 KCNMA1Q12791 1236 aa9.49□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.49□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 GSK3AP49840 483 aa9.48□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 GPR37O15354 613 aa9.47□□□□□ -0.89
ANKRD28-210ENST00000479043 VSIG8P0DPA2 414 aa9.46□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ZFP42Q96MM3 310 aa9.46□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 CD46P15529 392 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-210ENST00000479043 KDM4AO75164 1064 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 JUNDP17535 347 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 HLA-CQ95604 372 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 P3H3Q8IVL6 736 aa9.37□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.37□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 SH3BP2P78314 561 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 USP46P62068 366 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 SOBPA7XYQ1 873 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 HOXA2O43364 376 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD28-210ENST00000479043 RASSF7Q02833 373 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SCARF1Q14162 830 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GDF11O95390 407 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.31□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TIMP2P16035 220 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PLCB2Q00722 1185 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GUCA2AQ02747 115 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 NNTQ13423 1086 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 MPNDQ8N594 471 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 RETREG3Q86VR2 466 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PPFIA3O75145 1194 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 ADH1CP00326 375 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 KRT76Q01546 638 aa9.24□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 BAP1Q92560 729 aa9.24□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 MAN1A2O60476 641 aa9.23□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 MS4A1P11836 297 aa9.23□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 LINC01559Q495D7 138 aa9.23□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF511Q8NB15 262 aa9.23□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.23□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 PTPRNQ16849 979 aa9.22□□□□□ -0.93
ANKRD28-210ENST00000479043 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
ANKRD28-210ENST00000479043 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms