RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF3-208ENST00000477440 BRINP3Q76B58 766 aa36.63■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.62■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRAM1Q96QH2 718 aa36.61■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.59■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.58■■■■□ 3.45
ARHGEF3-208ENST00000477440 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.55■■■■□ 3.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 POGKQ9P215 609 aa36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADGRB2O60241 1585 aa36.53■■■■□ 3.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 TONSLQ96HA7 1378 aa36.52■■■■□ 3.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ORAI2Q96SN7 254 aa36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM2FA1L443 756 aa36.47■■■■□ 3.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP32Q8NFA0 1604 aa36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 SHPRHQ149N8 1683 aa36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 JCADQ9P266 1359 aa36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF1AQ12756 1690 aa36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF3-208ENST00000477440 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 PXDNQ92626 1479 aa36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF3-208ENST00000477440 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.26■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 FOXO3O43524 673 aa36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 ITSN1Q15811 1721 aa36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRP6O75581 1613 aa36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP7BP35670 1465 aa36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF3-208ENST00000477440 CDK19Q9BWU1 502 aa36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF3-208ENST00000477440 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF3-208ENST00000477440 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF3-208ENST00000477440 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF3-208ENST00000477440 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 PSME1Q06323 249 aa36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 CABP2Q9NPB3 220 aa36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 ILDR2Q71H61 639 aa36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 SBNO1A3KN83 1393 aa36■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 EVC2Q86UK5 1308 aa35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 ALS2Q96Q42 1657 aa35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF3-208ENST00000477440 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCA3Q99758 1704 aa35.94■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.92■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 ACEP12821 1306 aa35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTS2O95450 1211 aa35.91■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF10O15013 1369 aa35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF3-208ENST00000477440 C8orf37Q96NL8 207 aa35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP47Q96K76 1375 aa35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 POTEAQ6S8J7 498 aa35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 CABP1Q9NZU7 370 aa35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 AFF2P51816 1311 aa35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF3-208ENST00000477440 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHG5O94827 1062 aa35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF3-208ENST00000477440 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.82■■■■□ 3.32
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