RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477348.1

OTX1-205, Transcript of orthodenticle homeobox 1, humanhuman

TSL 3

Gene OTX1, Length 624 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1-205ENST00000477348 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.17■■□□□ 1.94
OTX1-205ENST00000477348 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.17■■□□□ 1.94
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OTX1-205ENST00000477348 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
OTX1-205ENST00000477348 PPLO60437 1756 aa27.15■■□□□ 1.94
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OTX1-205ENST00000477348 FOXO3O43524 673 aa27.11■■□□□ 1.93
OTX1-205ENST00000477348 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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OTX1-205ENST00000477348 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
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OTX1-205ENST00000477348 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
OTX1-205ENST00000477348 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.88■■□□□ 1.89
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OTX1-205ENST00000477348 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.51■■□□□ 1.83
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