RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.49■■■■■ 4.07
SOD1-203ENST00000470944 TMEM94Q12767 1356 aa40.46■■■■■ 4.07
SOD1-203ENST00000470944 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.45■■■■■ 4.07
SOD1-203ENST00000470944 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
SOD1-203ENST00000470944 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.43■■■■■ 4.06
SOD1-203ENST00000470944 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.42■■■■■ 4.06
SOD1-203ENST00000470944 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.4■■■■■ 4.06
SOD1-203ENST00000470944 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.38■■■■■ 4.06
SOD1-203ENST00000470944 TMF1P82094 1093 aa40.37■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 C14orf37Q86TY3 774 aa40.37■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.37■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 ADGRB2O60241 1585 aa40.35■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.33■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 EVC2Q86UK5 1308 aa40.32■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
SOD1-203ENST00000470944 CDK19Q9BWU1 502 aa40.31■■■■■ 4.04
SOD1-203ENST00000470944 SLC24A1O60721 1099 aa40.3■■■■■ 4.04
SOD1-203ENST00000470944 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.28■■■■■ 4.04
SOD1-203ENST00000470944 CABP2Q9NPB3 220 aa40.28■■■■■ 4.04
SOD1-203ENST00000470944 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.28■■■■■ 4.04
SOD1-203ENST00000470944 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.28■■■■■ 4.04
SOD1-203ENST00000470944 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SOD1-203ENST00000470944 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.24■■■■■ 4.03
SOD1-203ENST00000470944 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.23■■■■■ 4.03
SOD1-203ENST00000470944 CCDC7Q96M83 1385 aa40.22■■■■■ 4.03
SOD1-203ENST00000470944 NUTM2FA1L443 756 aa40.22■■■■■ 4.03
SOD1-203ENST00000470944 MSH6P52701 1360 aa40.2■■■■■ 4.03
SOD1-203ENST00000470944 CDCA8Q53HL2 280 aa40.18■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.18■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.15■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 DCCP43146 1447 aa40.15■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 ATP7BP35670 1465 aa40.14■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 ATF3P18847 181 aa40.13■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
SOD1-203ENST00000470944 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
SOD1-203ENST00000470944 USP32Q8NFA0 1604 aa40.12■■■■■ 4.01
SOD1-203ENST00000470944 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.1■■■■■ 4.01
SOD1-203ENST00000470944 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.09■■■■■ 4.01
SOD1-203ENST00000470944 MST1RQ04912 1400 aa40.06■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.06■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 CCDC61Q9Y6R9 512 aa40.05■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 TMC1Q8TDI8 760 aa40.04■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.04■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 MYOM1P52179 1685 aa40.02■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 CABP1Q9NZU7 370 aa40.02■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.02■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa40.01■■■■■ 4
SOD1-203ENST00000470944 CERKQ8TCT0 537 aa39.99■■■■□ 3.99
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SOD1-203ENST00000470944 ORAI2Q96SN7 254 aa39.97■■■■□ 3.99
SOD1-203ENST00000470944 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
SOD1-203ENST00000470944 ESCO1Q5FWF5 840 aa39.96■■■■□ 3.99
SOD1-203ENST00000470944 SLAIN2Q9P270 581 aa39.96■■■■□ 3.99
SOD1-203ENST00000470944 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39.94■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.92■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.91■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 ITSN1Q15811 1721 aa39.91■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.91■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 PLEKHG3A1L390 1219 aa39.91■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.89■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 PANK3Q9H999 370 aa39.88■■■■□ 3.98
SOD1-203ENST00000470944 ACEP12821 1306 aa39.86■■■■□ 3.97
SOD1-203ENST00000470944 A0A1W2PP64 1363 aa39.85■■■■□ 3.97
SOD1-203ENST00000470944 BRINP3Q76B58 766 aa39.84■■■■□ 3.97
SOD1-203ENST00000470944 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.83■■■■□ 3.97
SOD1-203ENST00000470944 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
SOD1-203ENST00000470944 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
SOD1-203ENST00000470944 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.81■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 TERF2IPQ9NYB0 399 aa39.81■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.8■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 TOM1O60784 492 aa39.79■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 FOXO3O43524 673 aa39.78■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
SOD1-203ENST00000470944 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
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SOD1-203ENST00000470944 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 AKAP12Q02952 1782 aa39.72■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 PIP4K2BP78356 416 aa39.71■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 USP6P35125 1406 aa39.71■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.71■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.7■■■■□ 3.95
SOD1-203ENST00000470944 MON2Q7Z3U7 1717 aa39.68■■■■□ 3.94
SOD1-203ENST00000470944 PSME1Q06323 249 aa39.68■■■■□ 3.94
SOD1-203ENST00000470944 SSH2Q76I76 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
SOD1-203ENST00000470944 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
SOD1-203ENST00000470944 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
SOD1-203ENST00000470944 NPHP3Q7Z494 1330 aa39.64■■■■□ 3.94
SOD1-203ENST00000470944 KRT28Q7Z3Y7 464 aa39.62■■■■□ 3.93
SOD1-203ENST00000470944 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
SOD1-203ENST00000470944 KNSTRNQ9Y448 316 aa39.62■■■■□ 3.93
SOD1-203ENST00000470944 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.62■■■■□ 3.93
SOD1-203ENST00000470944 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa39.59■■■■□ 3.93
SOD1-203ENST00000470944 PXDNQ92626 1479 aa39.59■■■■□ 3.93
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