RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, human

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	46.27	■■■■■ 5
HMG20B-209	ENST00000470356	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		46.25	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		46.23	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		46.23	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		46.23	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		46.21	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	46.21	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	46.21	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	46.2	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	MYOM2	P54296	1465 aa		46.19	■■■■■ 4.99
HMG20B-209	ENST00000470356	HRC	P23327	699 aa		46.17	■■■■■ 4.98
HMG20B-209	ENST00000470356	SIRT1	Q96EB6	747 aa		46.14	■■■■■ 4.98
HMG20B-209	ENST00000470356	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		46.13	■■■■■ 4.98
HMG20B-209	ENST00000470356	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		46.12	■■■■■ 4.97
HMG20B-209	ENST00000470356	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		46.11	■■■■■ 4.97
HMG20B-209	ENST00000470356	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	46.08	■■■■■ 4.97
HMG20B-209	ENST00000470356	AFF2	P51816	1311 aa		46.07	■■■■■ 4.97
HMG20B-209	ENST00000470356	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		46.05	■■■■■ 4.96
HMG20B-209	ENST00000470356	C8orf37	Q96NL8	207 aa		46.02	■■■■■ 4.96
HMG20B-209	ENST00000470356	NUTM2F	A1L443	756 aa		46.01	■■■■■ 4.96
HMG20B-209	ENST00000470356	RXRB	P28702	533 aa		46	■■■■■ 4.95
HMG20B-209	ENST00000470356	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		46	■■■■■ 4.95
HMG20B-209	ENST00000470356	FOXO3	O43524	673 aa		45.99	■■■■■ 4.95
HMG20B-209	ENST00000470356	PXDN	Q92626	1479 aa		45.97	■■■■■ 4.95
HMG20B-209	ENST00000470356	ADAMTS2	O95450	1211 aa		45.96	■■■■■ 4.95
HMG20B-209	ENST00000470356	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	45.94	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	NGLY1	Q96IV0	654 aa		45.92	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		45.91	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	STAC3	Q96MF2	364 aa		45.91	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	PRAM1	Q96QH2	718 aa		45.9	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	DLC1	Q96QB1	1528 aa		45.89	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	45.89	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	45.89	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		45.88	■■■■■ 4.94
HMG20B-209	ENST00000470356	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	45.87	■■■■■ 4.93
HMG20B-209	ENST00000470356	ADGRB1	O14514	1584 aa		45.87	■■■■■ 4.93
HMG20B-209	ENST00000470356	KIF1A	Q12756	1690 aa		45.85	■■■■■ 4.93
HMG20B-209	ENST00000470356	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	45.83	■■■■■ 4.93
HMG20B-209	ENST00000470356	POGK	Q9P215	609 aa		45.83	■■■■■ 4.93
HMG20B-209	ENST00000470356	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	45.83	■■■■■ 4.93
HMG20B-209	ENST00000470356	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	45.8	■■■■■ 4.92
HMG20B-209	ENST00000470356	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	45.77	■■■■■ 4.92
HMG20B-209	ENST00000470356	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		45.76	■■■■■ 4.92
HMG20B-209	ENST00000470356	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		45.76	■■■■■ 4.92
HMG20B-209	ENST00000470356	USP21	Q9UK80	565 aa		45.75	■■■■■ 4.91
HMG20B-209	ENST00000470356	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		45.74	■■■■■ 4.91
HMG20B-209	ENST00000470356	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		45.74	■■■■■ 4.91
HMG20B-209	ENST00000470356	ADGRB2	O60241	1585 aa		45.71	■■■■■ 4.91
HMG20B-209	ENST00000470356	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	45.7	■■■■■ 4.91
HMG20B-209	ENST00000470356	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	45.7	■■■■■ 4.91
HMG20B-209	ENST00000470356	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		45.68	■■■■■ 4.9
HMG20B-209	ENST00000470356	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	45.67	■■■■■ 4.9
HMG20B-209	ENST00000470356	PSME1	Q06323	249 aa		45.66	■■■■■ 4.9
HMG20B-209	ENST00000470356	RGS12	O14924	1447 aa		45.66	■■■■■ 4.9
HMG20B-209	ENST00000470356	USP32	Q8NFA0	1604 aa		45.63	■■■■■ 4.9
HMG20B-209	ENST00000470356	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	45.62	■■■■■ 4.89
HMG20B-209	ENST00000470356	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	45.61	■■■■■ 4.89
HMG20B-209	ENST00000470356	ATRN	O75882	1429 aa		45.59	■■■■■ 4.89
HMG20B-209	ENST00000470356	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		45.59	■■■■■ 4.89
HMG20B-209	ENST00000470356	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		45.58	■■■■■ 4.89
HMG20B-209	ENST00000470356	SBNO1	A3KN83	1393 aa		45.58	■■■■■ 4.89
HMG20B-209	ENST00000470356	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	45.57	■■■■■ 4.88
HMG20B-209	ENST00000470356	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		45.55	■■■■■ 4.88
HMG20B-209	ENST00000470356	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	45.54	■■■■■ 4.88
HMG20B-209	ENST00000470356	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	45.52	■■■■■ 4.88
HMG20B-209	ENST00000470356	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		45.5	■■■■■ 4.87
HMG20B-209	ENST00000470356	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		45.5	■■■■■ 4.87
HMG20B-209	ENST00000470356	ARHGEF10	O15013	1369 aa		45.48	■■■■■ 4.87
HMG20B-209	ENST00000470356	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		45.48	■■■■■ 4.87
HMG20B-209	ENST00000470356	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		45.45	■■■■■ 4.87
HMG20B-209	ENST00000470356	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	45.45	■■■■■ 4.87
HMG20B-209	ENST00000470356	SLIT2	O94813	1529 aa		45.44	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	45.44	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		45.44	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		45.42	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	45.41	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		45.41	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	45.4	■■■■■ 4.86
HMG20B-209	ENST00000470356	ABCA3	Q99758	1704 aa		45.37	■■■■■ 4.85
HMG20B-209	ENST00000470356	PLEKHG5	O94827	1062 aa		45.35	■■■■■ 4.85
HMG20B-209	ENST00000470356	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		45.34	■■■■■ 4.85
HMG20B-209	ENST00000470356	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		45.34	■■■■■ 4.85
HMG20B-209	ENST00000470356	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	45.33	■■■■■ 4.85
HMG20B-209	ENST00000470356	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	45.32	■■■■■ 4.85
HMG20B-209	ENST00000470356	ALS2	Q96Q42	1657 aa		45.31	■■■■■ 4.84
HMG20B-209	ENST00000470356	ITSN1	Q15811	1721 aa		45.31	■■■■■ 4.84
HMG20B-209	ENST00000470356	ATP7B	P35670	1465 aa		45.3	■■■■■ 4.84
HMG20B-209	ENST00000470356	CDK19	Q9BWU1	502 aa		45.29	■■■■■ 4.84
HMG20B-209	ENST00000470356	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		45.28	■■■■■ 4.84
HMG20B-209	ENST00000470356	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		45.27	■■■■■ 4.84
HMG20B-209	ENST00000470356	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		45.25	■■■■■ 4.83
HMG20B-209	ENST00000470356	GLI3	P10071	1580 aa		45.25	■■■■■ 4.83
HMG20B-209	ENST00000470356	FAM83G	A6ND36	823 aa		45.23	■■■■■ 4.83
HMG20B-209	ENST00000470356	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		45.23	■■■■■ 4.83
HMG20B-209	ENST00000470356	VPS72	Q15906	364 aa		45.22	■■■■■ 4.83
HMG20B-209	ENST00000470356	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	45.19	■■■■■ 4.82
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		45.18	■■■■■ 4.82
HMG20B-209	ENST00000470356	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		45.17	■■■■■ 4.82
HMG20B-209	ENST00000470356	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		45.15	■■■■■ 4.82
HMG20B-209	ENST00000470356	EP400	Q96L91	3159 aa		45.14	■■■■■ 4.82

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