RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468135.5

TMEM39B-205, Transcript of transmembrane protein 39B, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM39B, Length 1,834 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39B-205ENST00000468135 GGT6Q6P531 493 aa22.45■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 USP35Q9P2H5 1018 aa22.45■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 ABCC3O15438 1527 aa22.44■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 PDE3AQ14432 1141 aa22.44■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.43■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 CFAP53Q96M91 514 aa22.43■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 FAM161AQ3B820 660 aa22.43■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 RUNDC1Q96C34 613 aa22.43■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 NSD2O96028 1365 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 EVC2Q86UK5 1308 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 AAMPQ13685 434 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 NEO1Q92859 1461 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 WWC1Q8IX03 1113 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM39B-205ENST00000468135 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 SHPRHQ149N8 1683 aa22.39■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 PIK3C2BO00750 1634 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 GLI2P10070 1586 aa22.37■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 WDR63Q8IWG1 891 aa22.37■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 BCAR3O75815 825 aa22.36■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.35■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.35■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.35■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 CCDC27Q2M243 656 aa22.35■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TMEM39B-205ENST00000468135 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.33■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.32■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 ZFYVE9O95405 1425 aa22.32■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 MTHFSP49914 203 aa22.3■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 DIP2BQ9P265 1576 aa22.3■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.3■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.3■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 C8orf34Q49A92 452 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 NEFMP07197 916 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 SKAP1Q86WV1 359 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM39B-205ENST00000468135 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.27■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 RGS3P49796 1198 aa22.27■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 NEUROD2Q15784 382 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 RICTORQ6R327 1708 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 RAPGEF3O95398 923 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 COG6Q9Y2V7 657 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 ZMYM3Q14202 1370 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 IGHDP01880 384 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TMEM39B-205ENST00000468135 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 IDI1Q13907 227 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 PANK1Q8TE04 598 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 ABCC11Q96J66 1382 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 ADGRB2O60241 1585 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 CABP2Q9NPB3 220 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 MED14O60244 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 A0A1W2PP64 1363 aa22.14■■□□□ 1.14
TMEM39B-205ENST00000468135 POGKQ9P215 609 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 IL16Q14005 1332 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 STK26Q9P289 416 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 PTPRMP28827 1452 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 BECN1Q14457 450 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 NFKBIBQ15653 356 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM39B-205ENST00000468135 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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