RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NGLY1	Q96IV0	654 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BRINP3	Q76B58	766 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRIM52	Q96A61	297 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AFF2	P51816	1311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676		E9PCH4	1651 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRP6	O75581	1613 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PROM2	Q8N271	834 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MIER1	Q8N108	512 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MST1R	Q04912	1400 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC125	Q86Z20	511 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTPRU	Q92729	1446 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ITGAE	P38570	1179 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTCH1	Q13635	1447 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MET	P08581	1390 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP21	Q9UK80	565 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HFM1	A2PYH4	1435 aa		12.71	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF1B	O60333	1816 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGS12	O14924	1447 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LAMC1	P11047	1609 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NEFL	P07196	543 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.63	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLTCL1	P53675	1640 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PSME1	Q06323	249 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATRN	O75882	1429 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.6	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.6	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SIRT1	Q96EB6	747 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NAIP	Q13075	1403 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.58	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.58	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC11	Q96J66	1382 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FOXO3	O43524	673 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYOM2	P54296	1465 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TECPR2	O15040	1411 aa		12.55	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PXDN	Q92626	1479 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STK26	Q9P289	416 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPL	O60437	1756 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.52	□□□□□ -0.4
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41

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