RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466223.1

AGRN-204, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 459 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-204ENST00000466223 DLC1Q96QB1 1528 aa22.66■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
AGRN-204ENST00000466223 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 SLAIN2Q9P270 581 aa22.63■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 DCCP43146 1447 aa22.63■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.63■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.62■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.62■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.6■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 ILDR2Q71H61 639 aa22.58■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.58■■□□□ 1.21
AGRN-204ENST00000466223 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
AGRN-204ENST00000466223 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
AGRN-204ENST00000466223 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
AGRN-204ENST00000466223 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.54■■□□□ 1.2
AGRN-204ENST00000466223 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
AGRN-204ENST00000466223 MST1RQ04912 1400 aa22.51■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 NUTM2FA1L443 756 aa22.49■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 SOCS7O14512 581 aa22.49■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.49■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.48■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 ADGRB2O60241 1585 aa22.47■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.47■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.46■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.46■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 BRINP3Q76B58 766 aa22.46■■□□□ 1.19
AGRN-204ENST00000466223 CDK19Q9BWU1 502 aa22.44■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 SLC24A1O60721 1099 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 HSPA1LP34931 641 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 ORAI2Q96SN7 254 aa22.43■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 EVC2Q86UK5 1308 aa22.42■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 USP47Q96K76 1375 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.4■■□□□ 1.18
AGRN-204ENST00000466223 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.39■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.38■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.38■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 PHLPP1O60346 1717 aa22.37■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 CABP2Q9NPB3 220 aa22.36■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.35■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.35■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 KIF1AQ12756 1690 aa22.34■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 FOXO3O43524 673 aa22.34■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.33■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 USP32Q8NFA0 1604 aa22.33■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.33■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 ITSN1Q15811 1721 aa22.33■■□□□ 1.17
AGRN-204ENST00000466223 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.32■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 TMF1P82094 1093 aa22.31■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 PSME1Q06323 249 aa22.31■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 ATP7BP35670 1465 aa22.3■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 TESK2Q96S53 571 aa22.3■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 CDCA8Q53HL2 280 aa22.28■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.28■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.27■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
AGRN-204ENST00000466223 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.26■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.26■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 JCADQ9P266 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 CABP1Q9NZU7 370 aa22.25■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.23■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 TMC1Q8TDI8 760 aa22.23■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 ACEP12821 1306 aa22.23■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 PXDNQ92626 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
AGRN-204ENST00000466223 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.19■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 SBNO1A3KN83 1393 aa22.18■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.17■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.17■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 SHPRHQ149N8 1683 aa22.17■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.15■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.15■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.15■■□□□ 1.14
AGRN-204ENST00000466223 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.14■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 ARHGEF10O15013 1369 aa22.13■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.13■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AGRN-204ENST00000466223 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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