RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463025.1

NECTIN3-AS1-201, NECTIN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene NECTIN3-AS1, Length 413 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 HPS1Q92902 700 aa11.75□□□□□ -0.53
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 SENP2Q9HC62 589 aa11.75□□□□□ -0.53
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 GCGRP47871 477 aa11.73□□□□□ -0.53
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 HIC1Q14526 733 aa11.73□□□□□ -0.53
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.71□□□□□ -0.53
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.63□□□□□ -0.55
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 HLA-CQ95604 372 aa11.53□□□□□ -0.56
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 P3H3Q8IVL6 736 aa11.52□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 ERBB4Q15303 1308 aa11.52□□□□□ -0.57
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 H3BM21 787 aa11.49□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 SIAH2O43255 324 aa11.49□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.49□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 CD46P15529 392 aa11.48□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 KDM4AO75164 1064 aa11.47□□□□□ -0.57
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.45□□□□□ -0.58
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.45□□□□□ -0.58
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.38□□□□□ -0.59
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 USP46P62068 366 aa11.36□□□□□ -0.59
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.34□□□□□ -0.59
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NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.33□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.32□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 LINC01559Q495D7 138 aa11.3□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 RETREG3Q86VR2 466 aa11.29□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 VSIG8P0DPA2 414 aa11.28□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 GSK3AP49840 483 aa11.28□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 NNTQ13423 1086 aa11.28□□□□□ -0.6
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 KCNMA1Q12791 1236 aa11.27□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 SCARF1Q14162 830 aa11.27□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 BAP1Q92560 729 aa11.27□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.26□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 MS4A1P11836 297 aa11.25□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 TIMP2P16035 220 aa11.25□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 MAP2K5Q13163 448 aa11.25□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.25□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.24□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 C6orf229H3BNL8 230 aa11.23□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 IRF6O14896 467 aa11.23□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.22□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.22□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.21□□□□□ -0.61
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 ADH1CP00326 375 aa11.2□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 FDX1P10109 184 aa11.2□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 ZNF511Q8NB15 262 aa11.2□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 PPFIA3O75145 1194 aa11.18□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 KCNH2Q12809 1159 aa11.18□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 PTPRNQ16849 979 aa11.18□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.18□□□□□ -0.62
NECTIN3-AS1-201ENST00000463025 MPNDQ8N594 471 aa11.18□□□□□ -0.62
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