RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 BRINP3Q76B58 766 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 ADGRB1O14514 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 MST1RQ04912 1400 aa29.34■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.33■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.32■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.31■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.3■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.3■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.29■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.27■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.26■■■□□ 2.28
IMP4-209ENST00000462357 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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IMP4-209ENST00000462357 NUTM2FA1L443 756 aa29.23■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 ORAI2Q96SN7 254 aa29.23■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.21■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.21■■■□□ 2.27
IMP4-209ENST00000462357 JCADQ9P266 1359 aa29.2■■■□□ 2.26
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IMP4-209ENST00000462357 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.15■■■□□ 2.26
IMP4-209ENST00000462357 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.15■■■□□ 2.26
IMP4-209ENST00000462357 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
IMP4-209ENST00000462357 PHLPP1O60346 1717 aa29.14■■■□□ 2.26
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IMP4-209ENST00000462357 SLC24A1O60721 1099 aa29.14■■■□□ 2.26
IMP4-209ENST00000462357 PSME1Q06323 249 aa29.14■■■□□ 2.26
IMP4-209ENST00000462357 CDK19Q9BWU1 502 aa29.12■■■□□ 2.25
IMP4-209ENST00000462357 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.12■■■□□ 2.25
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IMP4-209ENST00000462357 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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IMP4-209ENST00000462357 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.09■■■□□ 2.25
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IMP4-209ENST00000462357 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
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IMP4-209ENST00000462357 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.05■■■□□ 2.24
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IMP4-209ENST00000462357 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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IMP4-209ENST00000462357 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.01■■■□□ 2.23
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IMP4-209ENST00000462357 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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IMP4-209ENST00000462357 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.93■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.93■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 SBNO1A3KN83 1393 aa28.92■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.92■■■□□ 2.22
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IMP4-209ENST00000462357 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF10O15013 1369 aa28.89■■■□□ 2.22
IMP4-209ENST00000462357 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.89■■■□□ 2.22
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IMP4-209ENST00000462357 ATP7BP35670 1465 aa28.88■■■□□ 2.21
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IMP4-209ENST00000462357 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
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IMP4-209ENST00000462357 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
IMP4-209ENST00000462357 NGLY1Q96IV0 654 aa28.81■■■□□ 2.2
IMP4-209ENST00000462357 C8orf37Q96NL8 207 aa28.79■■■□□ 2.2
IMP4-209ENST00000462357 TMC1Q8TDI8 760 aa28.78■■■□□ 2.2
IMP4-209ENST00000462357 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
IMP4-209ENST00000462357 TESK2Q96S53 571 aa28.76■■■□□ 2.19
IMP4-209ENST00000462357 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
IMP4-209ENST00000462357 ABTB2Q8N961 1025 aa28.74■■■□□ 2.19
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