RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 POGKQ9P215 609 aa26.36■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.36■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.35■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 PRAM1Q96QH2 718 aa26.35■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.33■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
DDR1-241ENST00000460944 MST1RQ04912 1400 aa26.32■■□□□ 1.8
DDR1-241ENST00000460944 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
DDR1-241ENST00000460944 HSPA1LP34931 641 aa26.3■■□□□ 1.8
DDR1-241ENST00000460944 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
DDR1-241ENST00000460944 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.26■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.26■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.26■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.25■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 BRINP3Q76B58 766 aa26.24■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 ADGRB2O60241 1585 aa26.24■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.23■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 PHLPP1O60346 1717 aa26.22■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
DDR1-241ENST00000460944 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.2■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 NUTM2FA1L443 756 aa26.18■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.17■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 ORAI2Q96SN7 254 aa26.16■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.16■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.15■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.15■■□□□ 1.78
DDR1-241ENST00000460944 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.13■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 KIF1AQ12756 1690 aa26.12■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.11■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 USP32Q8NFA0 1604 aa26.08■■□□□ 1.77
DDR1-241ENST00000460944 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.07■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 JCADQ9P266 1359 aa26.06■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 ITSN1Q15811 1721 aa26.05■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 CDK19Q9BWU1 502 aa26.05■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.05■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 FOXO3O43524 673 aa26.03■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 ATP7BP35670 1465 aa26.02■■□□□ 1.76
DDR1-241ENST00000460944 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 SHPRHQ149N8 1683 aa26.01■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.01■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 EVC2Q86UK5 1308 aa26■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.99■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.98■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 PXDNQ92626 1479 aa25.98■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.96■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 USP47Q96K76 1375 aa25.95■■□□□ 1.75
DDR1-241ENST00000460944 CABP2Q9NPB3 220 aa25.95■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.95■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.94■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 PSME1Q06323 249 aa25.94■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.93■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.93■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.91■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 SLC24A1O60721 1099 aa25.9■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.89■■□□□ 1.74
DDR1-241ENST00000460944 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.88■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.87■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.87■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 SBNO1A3KN83 1393 aa25.86■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.86■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.86■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 TESK2Q96S53 571 aa25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 ACEP12821 1306 aa25.84■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
DDR1-241ENST00000460944 LRP6O75581 1613 aa25.82■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 CABP1Q9NZU7 370 aa25.82■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF10O15013 1369 aa25.82■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.81■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 TMF1P82094 1093 aa25.8■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.728e-8■■■■■ 39.6
DDR1-241ENST00000460944 ALS2Q96Q42 1657 aa25.77■■□□□ 1.72
DDR1-241ENST00000460944 TMC1Q8TDI8 760 aa25.75■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 AKAP12Q02952 1782 aa25.74■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 CDCA8Q53HL2 280 aa25.74■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 USP6P35125 1406 aa25.72■■□□□ 1.71
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