RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.64■■■□□ 2.34
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RPUSD3-210ENST00000460909 PRAM1Q96QH2 718 aa29.62■■■□□ 2.33
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RPUSD3-210ENST00000460909 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.6■■■□□ 2.33
RPUSD3-210ENST00000460909 HSPA1LP34931 641 aa29.59■■■□□ 2.33
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RPUSD3-210ENST00000460909 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
RPUSD3-210ENST00000460909 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.54■■■□□ 2.32
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RPUSD3-210ENST00000460909 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.43■■■□□ 2.3
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RPUSD3-210ENST00000460909 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
RPUSD3-210ENST00000460909 NUTM2FA1L443 756 aa29.41■■■□□ 2.3
RPUSD3-210ENST00000460909 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
RPUSD3-210ENST00000460909 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
RPUSD3-210ENST00000460909 USP32Q8NFA0 1604 aa29.39■■■□□ 2.3
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RPUSD3-210ENST00000460909 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.37■■■□□ 2.29
RPUSD3-210ENST00000460909 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.36■■■□□ 2.29
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RPUSD3-210ENST00000460909 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.32■■■□□ 2.28
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RPUSD3-210ENST00000460909 KIF1AQ12756 1690 aa29.3■■■□□ 2.28
RPUSD3-210ENST00000460909 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP7BP35670 1465 aa29.28■■■□□ 2.28
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RPUSD3-210ENST00000460909 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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RPUSD3-210ENST00000460909 SLC24A1O60721 1099 aa29.01■■■□□ 2.23
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RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF10O15013 1369 aa28.96■■■□□ 2.23
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RPUSD3-210ENST00000460909 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.92■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 SSH2Q76I76 1423 aa28.92■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCA3Q99758 1704 aa28.91■■■□□ 2.22
RPUSD3-210ENST00000460909 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.91■■■□□ 2.22
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