RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.71□□□□□ -0.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYOM2P54296 1465 aa12.7□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 PXDNQ92626 1479 aa12.7□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORAI2Q96SN7 254 aa12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.68□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.67□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.67□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRB1O14514 1584 aa12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRB2O60241 1585 aa12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGL3Q3MIN7 710 aa12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCC11Q96J66 1382 aa12.66□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCH1Q4KWH8 1693 aa12.65□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
GAPDHP28-201ENST00000455134 AFF2P51816 1311 aa12.64□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLC1Q96QB1 1528 aa12.64□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALS2Q96Q42 1657 aa12.64□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS12O14924 1447 aa12.63□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.63□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.63□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITSN1Q15811 1721 aa12.62□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.62□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.62□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRAPQ86VF7 1730 aa12.61□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK26Q9P289 416 aa12.6□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLI3P10071 1580 aa12.6□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.59□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 EP400Q96L91 3159 aa12.59□□□□□ -0.39
GAPDHP28-201ENST00000455134 RXRBP28702 533 aa12.58□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFAP70Q5T0N1 1121 aa12.58□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf37Q96NL8 207 aa12.58□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATRNO75882 1429 aa12.57□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUTM2FA1L443 756 aa12.57□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.57□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.57□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.57□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXO3O43524 673 aa12.56□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAMTS2O95450 1211 aa12.56□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIRT1Q96EB6 747 aa12.56□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLIT2O94813 1529 aa12.54□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 NGLY1Q96IV0 654 aa12.53□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.53□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.53□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TULP4Q9NRJ4 1543 aa12.52□□□□□ -0.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKARQ7Z5J8 1434 aa12.52□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRAM1Q96QH2 718 aa12.51□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP21Q9UK80 565 aa12.51□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.51□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP7BP35670 1465 aa12.49□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR36Q9H6K5 1346 aa12.49□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRCP23327 699 aa12.49□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.48□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 SBNO1A3KN83 1393 aa12.48□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.48□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.48□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.47□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.46□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.46□□□□□ -0.41
GAPDHP28-201ENST00000455134 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.45□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKAP12Q02952 1782 aa12.45□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.45□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGPD5Q99666 1765 aa12.44□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.44□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.43□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.43□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 POGKQ9P215 609 aa12.43□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.43□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.43□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.42□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.42□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNC5CLQ8IV45 518 aa12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms