RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1-204ENST00000442563 POGKQ9P215 609 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1-204ENST00000442563 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1-204ENST00000442563 BRINP3Q76B58 766 aa24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1-204ENST00000442563 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ORAI2Q96SN7 254 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRB2O60241 1585 aa24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 NUTM2FA1L443 756 aa24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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RABGEF1-204ENST00000442563 PHLPP1O60346 1717 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 JCADQ9P266 1359 aa24■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 RALGAPBQ86X10 1494 aa24■■□□□ 1.43
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RABGEF1-204ENST00000442563 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXO3O43524 673 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK19Q9BWU1 502 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1-204ENST00000442563 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.89■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF1AQ12756 1690 aa23.89■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 USP32Q8NFA0 1604 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 EVC2Q86UK5 1308 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 PSME1Q06323 249 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 PXDNQ92626 1479 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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RABGEF1-204ENST00000442563 ATP7BP35670 1465 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
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RABGEF1-204ENST00000442563 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC24A1O60721 1099 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 CABP2Q9NPB3 220 aa23.83■■□□□ 1.41
RABGEF1-204ENST00000442563 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SBNO1A3KN83 1393 aa23.81■■□□□ 1.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.79■■□□□ 1.4
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 TESK2Q96S53 571 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 ACEP12821 1306 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 ITSN1Q15811 1721 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 USP47Q96K76 1375 aa23.75■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 LRP6O75581 1613 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 CABP1Q9NZU7 370 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.74■■□□□ 1.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF10O15013 1369 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1-204ENST00000442563 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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RABGEF1-204ENST00000442563 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTS2O95450 1211 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1-204ENST00000442563 TMF1P82094 1093 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1-204ENST00000442563 CDCA8Q53HL2 280 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf37Q96NL8 207 aa23.62■■□□□ 1.37
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