RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 RGS12O14924 1447 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.35■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.34■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 LAMC1P11047 1609 aa18.34■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.34■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.33■□□□□ 0.53
PRAME-208ENST00000438888 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.33■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 USP21Q9UK80 565 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 FOXO3O43524 673 aa18.3■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 TECPR2O15040 1411 aa18.29■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 PIK3C2GO75747 1445 aa18.29■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.29■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 PXDNQ92626 1479 aa18.28■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 IFT172Q9UG01 1749 aa18.28■□□□□ 0.52
PRAME-208ENST00000438888 MYOM2P54296 1465 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 ABCC11Q96J66 1382 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.23■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 HRCP23327 699 aa18.23■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHG5O94827 1062 aa18.22■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 ATRNO75882 1429 aa18.22■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.21■□□□□ 0.51
PRAME-208ENST00000438888 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 BCL9LQ86UU0 1499 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 PRAM1Q96QH2 718 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 KIF1AQ12756 1690 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.16■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.16■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.15■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 POGKQ9P215 609 aa18.15■□□□□ 0.5
PRAME-208ENST00000438888 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.14■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.14■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 SIRT1Q96EB6 747 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.12■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.12■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 PSME1Q06323 249 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 USP32Q8NFA0 1604 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 SLIT2O94813 1529 aa18.1■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.1■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.1■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 EP400Q96L91 3159 aa18.08■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRAME-208ENST00000438888 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 GLI3P10071 1580 aa18.08■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 DLC1Q96QB1 1528 aa18.08■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 ADGRB1O14514 1584 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 SBNO1A3KN83 1393 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF10O15013 1369 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 ADGRB2O60241 1585 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 ABCA3Q99758 1704 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 A0A0G2JS52 829 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 MYT1Q01538 1121 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-208ENST00000438888 VPS72Q15906 364 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 FAM83GA6ND36 823 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 CCDC125Q86Z20 511 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 WASLO00401 505 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.98■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 BTG4Q9NY30 223 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-208ENST00000438888 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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