RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438436.2

RNASEH1-AS1-202, RNASEH1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNASEH1-AS1, Length 1,218 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SLIT2O94813 1529 aa24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CLTCL1P53675 1640 aa24.75■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.74■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.74■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 USP32Q8NFA0 1604 aa24.72■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.71■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.71■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KIF1BO60333 1816 aa24.7■■□□□ 1.55
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ABCA3Q99758 1704 aa24.69■■□□□ 1.54
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.67■■□□□ 1.54
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 HRCP23327 699 aa24.67■■□□□ 1.54
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.64■■□□□ 1.54
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.64■■□□□ 1.54
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.62■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NUP155O75694 1391 aa24.62■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.61■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NRAPQ86VF7 1730 aa24.6■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.59■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PPLO60437 1756 aa24.59■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 HFM1A2PYH4 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.58■■□□□ 1.52
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KIF1AQ12756 1690 aa24.56■■□□□ 1.52
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ROCK1Q13464 1354 aa24.55■■□□□ 1.52
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FOXO3O43524 673 aa24.55■■□□□ 1.52
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.55■■□□□ 1.52
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 APLP2Q06481 763 aa24.51■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.51■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 VPS72Q15906 364 aa24.5■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NAIPQ13075 1403 aa24.5■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 BAG6P46379 1132 aa24.49■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.49■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.49■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 IFT172Q9UG01 1749 aa24.49■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RREB1Q92766 1687 aa24.45■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.45■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NUTM2FA1L443 756 aa24.44■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 DISP2A7MBM2 1401 aa24.44■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 YY1P25490 414 aa24.43■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.43■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.43■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.43■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.4■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.4■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TECPR2O15040 1411 aa24.39■■□□□ 1.5
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FAM182BQ5T319 152 aa24.38■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ADGRB2O60241 1585 aa24.37■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.37■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.37■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.34■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PLEKHG5O94827 1062 aa24.33■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.33■■□□□ 1.49
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 A0A0G2JS52 829 aa24.32■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 MYT1Q01538 1121 aa24.32■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ALS2Q96Q42 1657 aa24.31■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FAM83GA6ND36 823 aa24.3■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.29■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.27■■□□□ 1.48
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.26■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SBNO1A3KN83 1393 aa24.26■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ITGAEP38570 1179 aa24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 STK26Q9P289 416 aa24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ARHGEF10O15013 1369 aa24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 BTG4Q9NY30 223 aa24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 UTRNP46939 3433 aa24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ABCC11Q96J66 1382 aa24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CASZ1Q86V15 1759 aa24.18■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TRIM37O94972 964 aa24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PSME1Q06323 249 aa24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PIK3C2GO75747 1445 aa24.14■■□□□ 1.45
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms