RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.69■■■□□ 2.18
MUC1-211ENST00000438413 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
MUC1-211ENST00000438413 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.67■■■□□ 2.18
MUC1-211ENST00000438413 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.65■■■□□ 2.18
MUC1-211ENST00000438413 RGL3Q3MIN7 710 aa28.64■■■□□ 2.18
MUC1-211ENST00000438413 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.64■■■□□ 2.18
MUC1-211ENST00000438413 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.64■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 TECPR2O15040 1411 aa28.63■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 USP21Q9UK80 565 aa28.63■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.63■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.62■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 PXDNQ92626 1479 aa28.61■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 STK26Q9P289 416 aa28.6■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 MYOM2P54296 1465 aa28.59■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.59■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.58■■■□□ 2.17
MUC1-211ENST00000438413 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
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MUC1-211ENST00000438413 PIK3C2GO75747 1445 aa28.57■■■□□ 2.16
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MUC1-211ENST00000438413 ABCC11Q96J66 1382 aa28.56■■■□□ 2.16
MUC1-211ENST00000438413 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.55■■■□□ 2.16
MUC1-211ENST00000438413 NUTM2FA1L443 756 aa28.55■■■□□ 2.16
MUC1-211ENST00000438413 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
MUC1-211ENST00000438413 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.55■■■□□ 2.16
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MUC1-211ENST00000438413 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.54■■■□□ 2.16
MUC1-211ENST00000438413 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.53■■■□□ 2.16
MUC1-211ENST00000438413 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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MUC1-211ENST00000438413 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.42■■■□□ 2.14
MUC1-211ENST00000438413 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
MUC1-211ENST00000438413 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.42■■■□□ 2.14
MUC1-211ENST00000438413 SIRT1Q96EB6 747 aa28.41■■■□□ 2.14
MUC1-211ENST00000438413 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
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MUC1-211ENST00000438413 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
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MUC1-211ENST00000438413 SLIT2O94813 1529 aa28.37■■■□□ 2.13
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MUC1-211ENST00000438413 GLI3P10071 1580 aa28.35■■■□□ 2.13
MUC1-211ENST00000438413 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.35■■■□□ 2.13
MUC1-211ENST00000438413 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.34■■■□□ 2.13
MUC1-211ENST00000438413 EP400Q96L91 3159 aa28.34■■■□□ 2.13
MUC1-211ENST00000438413 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.33■■■□□ 2.13
MUC1-211ENST00000438413 PRAM1Q96QH2 718 aa28.32■■■□□ 2.12
MUC1-211ENST00000438413 PSME1Q06323 249 aa28.31■■■□□ 2.12
MUC1-211ENST00000438413 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
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MUC1-211ENST00000438413 SBNO1A3KN83 1393 aa28.27■■■□□ 2.12
MUC1-211ENST00000438413 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.27■■■□□ 2.12
MUC1-211ENST00000438413 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.26■■■□□ 2.12
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MUC1-211ENST00000438413 POGKQ9P215 609 aa28.26■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 PLEKHG5O94827 1062 aa28.25■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.25■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.25■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 ADGRB1O14514 1584 aa28.24■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.24■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 ARHGEF10O15013 1369 aa28.24■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.22■■■□□ 2.11
MUC1-211ENST00000438413 VPS72Q15906 364 aa28.2■■■□□ 2.1
MUC1-211ENST00000438413 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
MUC1-211ENST00000438413 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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MUC1-211ENST00000438413 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.17■■■□□ 2.1
MUC1-211ENST00000438413 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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MUC1-211ENST00000438413 NRAPQ86VF7 1730 aa28.15■■■□□ 2.1
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MUC1-211ENST00000438413 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.13■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.12■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.12■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.11■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 FAM83GA6ND36 823 aa28.11■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.08■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.08■■■□□ 2.09
MUC1-211ENST00000438413 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.07■■■□□ 2.08
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