RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429794.1

CITED1-205, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-205ENST00000429794 ORAI2Q96SN7 254 aa18.55■□□□□ 0.56
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CITED1-205ENST00000429794 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.52■□□□□ 0.56
CITED1-205ENST00000429794 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
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CITED1-205ENST00000429794 RGS12O14924 1447 aa18.5■□□□□ 0.55
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CITED1-205ENST00000429794 ARHGEF10O15013 1369 aa18.28■□□□□ 0.52
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CITED1-205ENST00000429794 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.26■□□□□ 0.51
CITED1-205ENST00000429794 POGKQ9P215 609 aa18.26■□□□□ 0.51
CITED1-205ENST00000429794 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CITED1-205ENST00000429794 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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CITED1-205ENST00000429794 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
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CITED1-205ENST00000429794 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.23■□□□□ 0.51
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CITED1-205ENST00000429794 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.2■□□□□ 0.5
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CITED1-205ENST00000429794 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CITED1-205ENST00000429794 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.19■□□□□ 0.5
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CITED1-205ENST00000429794 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.18■□□□□ 0.5
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CITED1-205ENST00000429794 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.17■□□□□ 0.5
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CITED1-205ENST00000429794 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.16■□□□□ 0.5
CITED1-205ENST00000429794 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CITED1-205ENST00000429794 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.16■□□□□ 0.5
CITED1-205ENST00000429794 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.15■□□□□ 0.5
CITED1-205ENST00000429794 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.15■□□□□ 0.5
CITED1-205ENST00000429794 FAM83GA6ND36 823 aa18.14■□□□□ 0.49
CITED1-205ENST00000429794 ATP7BP35670 1465 aa18.13■□□□□ 0.49
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