RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
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LMO1-202ENST00000428101 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 HRCP23327 699 aa40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
LMO1-202ENST00000428101 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
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LMO1-202ENST00000428101 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.13■■■■■ 4.01
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LMO1-202ENST00000428101 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 C8orf37Q96NL8 207 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 ADGRB1O14514 1584 aa39.93■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 PRAM1Q96QH2 718 aa39.92■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 ADAMTS2O95450 1211 aa39.9■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
LMO1-202ENST00000428101 DLC1Q96QB1 1528 aa39.9■■■■□ 3.98
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LMO1-202ENST00000428101 NGLY1Q96IV0 654 aa39.82■■■■□ 3.97
LMO1-202ENST00000428101 POGKQ9P215 609 aa39.82■■■■□ 3.97
LMO1-202ENST00000428101 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.81■■■■□ 3.96
LMO1-202ENST00000428101 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
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LMO1-202ENST00000428101 ADGRB2O60241 1585 aa39.75■■■■□ 3.95
LMO1-202ENST00000428101 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa39.73■■■■□ 3.95
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LMO1-202ENST00000428101 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
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LMO1-202ENST00000428101 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
LMO1-202ENST00000428101 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
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LMO1-202ENST00000428101 USP21Q9UK80 565 aa39.69■■■■□ 3.94
LMO1-202ENST00000428101 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.68■■■■□ 3.94
LMO1-202ENST00000428101 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
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LMO1-202ENST00000428101 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
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LMO1-202ENST00000428101 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.59■■■■□ 3.93
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LMO1-202ENST00000428101 ATRNO75882 1429 aa39.58■■■■□ 3.93
LMO1-202ENST00000428101 BCL9LQ86UU0 1499 aa39.58■■■■□ 3.93
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LMO1-202ENST00000428101 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
LMO1-202ENST00000428101 ARHGEF10O15013 1369 aa39.47■■■■□ 3.91
LMO1-202ENST00000428101 SLIT2O94813 1529 aa39.47■■■■□ 3.91
LMO1-202ENST00000428101 LMOD2Q6P5Q4 547 aa39.47■■■■□ 3.91
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LMO1-202ENST00000428101 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
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LMO1-202ENST00000428101 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
LMO1-202ENST00000428101 UNC5CLQ8IV45 518 aa39.42■■■■□ 3.9
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LMO1-202ENST00000428101 FAM83GA6ND36 823 aa39.3■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.3■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.3■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.29■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 NEUROD1Q13562 356 aa39.26■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.26■■■■□ 3.88
LMO1-202ENST00000428101 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
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