RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 MYOM2P54296 1465 aa41.24■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.24■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.23■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 HRCP23327 699 aa41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 PNPLA6Q8IY17 1366 aa41.22■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.2■■■■■ 4.19
TRIOBP-209ENST00000428075 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
TRIOBP-209ENST00000428075 SIRT1Q96EB6 747 aa41.12■■■■■ 4.17
TRIOBP-209ENST00000428075 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.09■■■■■ 4.17
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
TRIOBP-209ENST00000428075 NUTM2FA1L443 756 aa41.06■■■■■ 4.16
TRIOBP-209ENST00000428075 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
TRIOBP-209ENST00000428075 AFF2P51816 1311 aa41.03■■■■■ 4.16
TRIOBP-209ENST00000428075 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.02■■■■■ 4.16
TRIOBP-209ENST00000428075 PXDNQ92626 1479 aa41.02■■■■■ 4.16
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRB1O14514 1584 aa41.01■■■■■ 4.16
TRIOBP-209ENST00000428075 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.99■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 FOXO3O43524 673 aa40.99■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.99■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.98■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 C8orf37Q96NL8 207 aa40.97■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 PRAM1Q96QH2 718 aa40.97■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
TRIOBP-209ENST00000428075 DLC1Q96QB1 1528 aa40.94■■■■■ 4.14
TRIOBP-209ENST00000428075 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAMTS2O95450 1211 aa40.93■■■■■ 4.14
TRIOBP-209ENST00000428075 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
TRIOBP-209ENST00000428075 RXRBP28702 533 aa40.88■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 STAC3Q96MF2 364 aa40.86■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.85■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 NGLY1Q96IV0 654 aa40.84■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 POGKQ9P215 609 aa40.84■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF1AQ12756 1690 aa40.83■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
TRIOBP-209ENST00000428075 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.79■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRB2O60241 1585 aa40.78■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.77■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.77■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 USP32Q8NFA0 1604 aa40.77■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
TRIOBP-209ENST00000428075 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
TRIOBP-209ENST00000428075 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.71■■■■■ 4.11
TRIOBP-209ENST00000428075 USP21Q9UK80 565 aa40.71■■■■■ 4.11
TRIOBP-209ENST00000428075 RGS12O14924 1447 aa40.69■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.67■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa40.65■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.64■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.64■■■■■ 4.1
TRIOBP-209ENST00000428075 ATRNO75882 1429 aa40.63■■■■■ 4.09
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TRIOBP-209ENST00000428075 SBNO1A3KN83 1393 aa40.61■■■■■ 4.09
TRIOBP-209ENST00000428075 PSME1Q06323 249 aa40.61■■■■■ 4.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
TRIOBP-209ENST00000428075 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.59■■■■■ 4.09
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.56■■■■■ 4.08
TRIOBP-209ENST00000428075 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.56■■■■■ 4.08
TRIOBP-209ENST00000428075 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.56■■■■■ 4.08
TRIOBP-209ENST00000428075 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
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TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF10O15013 1369 aa40.48■■■■■ 4.07
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TRIOBP-209ENST00000428075 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.47■■■■■ 4.07
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA3Q99758 1704 aa40.47■■■■■ 4.07
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TRIOBP-209ENST00000428075 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.46■■■■■ 4.07
TRIOBP-209ENST00000428075 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.45■■■■■ 4.07
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TRIOBP-209ENST00000428075 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
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TRIOBP-209ENST00000428075 NEUROD1Q13562 356 aa40.29■■■■■ 4.04
TRIOBP-209ENST00000428075 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.29■■■■■ 4.04
TRIOBP-209ENST00000428075 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.28■■■■■ 4.04
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TRIOBP-209ENST00000428075 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
TRIOBP-209ENST00000428075 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
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