RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 SLC19A1P41440 591 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 C6orf229H3BNL8 230 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 MSS51Q4VC12 460 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 GFRA3O60609 400 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 SPRYD7Q5W111 196 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 TNFRSF10AO00220 468 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-208ENST00000427110 MMP16P51512 607 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 RIC3Q7Z5B4 369 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 RETREG3Q86VR2 466 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 FAM117AQ9C073 453 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 SPTLC1O15269 473 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 JUNDP17535 347 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 FOXC1Q12948 553 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 MTMR2Q13614 643 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 QPCTQ16769 361 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 Q6ZNB5 142 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PRR7Q8TB68 274 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 CFAP99D6REC4 459 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 HRCP23327 699 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NEUROD2Q15784 382 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 LCE2BO14633 110 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM32Q13049 653 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 TSC1Q92574 1164 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 RPIAP49247 311 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 DIXDC1Q155Q3 683 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB3Q9H5J0 574 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 GDF9O60383 454 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 GJA5P36382 358 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-208ENST00000427110 LINC01559Q495D7 138 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-208ENST00000427110 LILRB3O75022 631 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 SKOR1P84550 965 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 LAPTM4AQ15012 233 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 PTPRNQ16849 979 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 IL27Q8NEV9 243 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 MAP10Q9P2G4 905 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 CTHP32929 405 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 PRR20EP86478 221 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-208ENST00000427110 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 KCNH2Q12809 1159 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 PKDCCQ504Y2 493 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 SH3D19Q5HYK7 790 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 DESI1Q6ICB0 168 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 LYPD8Q6UX82 237 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 CYP4X1Q8N118 509 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 BAP1Q92560 729 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-208ENST00000427110 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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