RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.78■□□□□ 0.76
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.77■□□□□ 0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOM2P54296 1465 aa19.76■□□□□ 0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXDNQ92626 1479 aa19.76■□□□□ 0.75
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.62■□□□□ 0.73
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa19.61■□□□□ 0.73
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLIT2O94813 1529 aa19.6■□□□□ 0.73
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAM1Q96QH2 718 aa19.52■□□□□ 0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SBNO1A3KN83 1393 aa19.52■□□□□ 0.71
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSME1Q06323 249 aa19.51■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKARQ7Z5J8 1434 aa19.51■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRB1O14514 1584 aa19.5■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF10O15013 1369 aa19.49■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.49■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.48■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.48■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POGKQ9P215 609 aa19.47■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS72Q15906 364 aa19.46■□□□□ 0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHG5O94827 1062 aa19.45■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.45■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRAPQ86VF7 1730 aa19.45■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALS2Q96Q42 1657 aa19.44■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.44■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.43■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPT12Q8IYM1 358 aa19.43■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.41■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa19.4■□□□□ 0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.39■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR36Q9H6K5 1346 aa19.39■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM83GA6ND36 823 aa19.38■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITSN1Q15811 1721 aa19.37■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.37■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.37■□□□□ 0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
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