RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NWD1Q149M9 1564 aa23.57■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 EVC2Q86UK5 1308 aa23.57■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.55■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.49■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.49■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.46■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK19Q9BWU1 502 aa23.46■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRB2O60241 1585 aa23.46■■□□□ 1.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.44■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.43■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CABP2Q9NPB3 220 aa23.42■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.4■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM94Q12767 1356 aa23.4■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C14orf37Q86TY3 774 aa23.4■■□□□ 1.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.37■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.36■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.35■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.35■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMC1Q8TDI8 760 aa23.34■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.34■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCCP43146 1447 aa23.34■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.33■■□□□ 1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP7BP35670 1465 aa23.32■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.31■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 PANK3Q9H999 370 aa23.31■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.31■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.31■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 MSH6P52701 1360 aa23.3■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 CABP1Q9NZU7 370 aa23.29■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.29■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATF3P18847 181 aa23.28■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.28■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.27■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOM1P52179 1685 aa23.27■■□□□ 1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.26■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUTM2FA1L443 756 aa23.26■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.25■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.24■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.23■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PP64 1363 aa23.22■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.21■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP32Q8NFA0 1604 aa23.21■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.2■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MST1RQ04912 1400 aa23.19■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.19■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.19■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANP32CO43423 234 aa23.18■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACEP12821 1306 aa23.18■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.17■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.17■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.17■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.16■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.15■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITSN1Q15811 1721 aa23.15■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.15■■□□□ 1.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 ORAI2Q96SN7 254 aa23.13■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLAIN2Q9P270 581 aa23.13■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP6P35125 1406 aa23.11■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSD2O96028 1365 aa23.1■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 RALBP1Q15311 655 aa23.09■■□□□ 1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIER1Q8N108 512 aa23.07■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.07■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSH2Q76I76 1423 aa23.06■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSME1Q06323 249 aa23.06■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.06■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.06■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF1AQ12756 1690 aa23.05■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRINP3Q76B58 766 aa23.05■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.04■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 FYB1O15117 783 aa23.04■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXO3O43524 673 aa23.04■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.03■■□□□ 1.28
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