RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.99■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 IGHDP01880 384 aa27.99■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 MORC1Q86VD1 984 aa27.99■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 RUNDC1Q96C34 613 aa27.94■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 PANK1Q8TE04 598 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.91■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 COG6Q9Y2V7 657 aa27.91■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.91■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 GLI2P10070 1586 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC3O15438 1527 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 IL27Q8NEV9 243 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 NFKBIBQ15653 356 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM200B-201ENST00000420504 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 NEUROD2Q15784 382 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 GGT6Q6P531 493 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 MTHFSP49914 203 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR63Q8IWG1 891 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 PIK3C2BO00750 1634 aa27.85■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 USP19O94966 1318 aa27.84■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC27Q2M243 656 aa27.84■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.84■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 CD109Q6YHK3 1445 aa27.83■■■□□ 2.05
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 NSD2O96028 1365 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 AAMPQ13685 434 aa27.8■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 CFAP53Q96M91 514 aa27.8■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGRB2O60241 1585 aa27.8■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 RLBP1P12271 317 aa27.8■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 EVC2Q86UK5 1308 aa27.79■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 TNNQ9UQP3 1299 aa27.78■■■□□ 2.04
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.76■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 GSE1Q14687 1217 aa27.76■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 SEC24BO95487 1268 aa27.75■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 NLRP1Q9C000 1473 aa27.75■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.75■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
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TMEM200B-201ENST00000420504 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.73■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 ZMYM3Q14202 1370 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 CABP2Q9NPB3 220 aa27.7■■■□□ 2.03
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC11Q96J66 1382 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.68■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A1W2PP64 1363 aa27.67■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.67■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 ZFYVE9O95405 1425 aa27.66■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.65■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.64■■■□□ 2.02
TMEM200B-201ENST00000420504 NEO1Q92859 1461 aa27.64■■■□□ 2.01
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TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.63■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.63■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 RAPGEF3O95398 923 aa27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 IDI1Q13907 227 aa27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.61■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPRMP28827 1452 aa27.6■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TMEM200B-201ENST00000420504 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 MED14O60244 1454 aa27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 BECN1Q14457 450 aa27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 RICTORQ6R327 1708 aa27.57■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.56■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.56■■■□□ 2
TMEM200B-201ENST00000420504 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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