RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.83■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.83■■■□□ 2.37
GTPBP1-202ENST00000418601 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.82■■■□□ 2.36
GTPBP1-202ENST00000418601 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
GTPBP1-202ENST00000418601 PXDNQ92626 1479 aa29.79■■■□□ 2.36
GTPBP1-202ENST00000418601 NUP155O75694 1391 aa29.77■■■□□ 2.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.77■■■□□ 2.36
GTPBP1-202ENST00000418601 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.74■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.74■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 SLIT2O94813 1529 aa29.72■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.72■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 CLTCL1P53675 1640 aa29.71■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.7■■■□□ 2.35
GTPBP1-202ENST00000418601 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.7■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 USP32Q8NFA0 1604 aa29.68■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.67■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 ROCK1Q13464 1354 aa29.66■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 HFM1A2PYH4 1435 aa29.66■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 HRCP23327 699 aa29.66■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.64■■■□□ 2.34
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF1BO60333 1816 aa29.64■■■□□ 2.33
GTPBP1-202ENST00000418601 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.62■■■□□ 2.33
GTPBP1-202ENST00000418601 FOXO3O43524 673 aa29.61■■■□□ 2.33
GTPBP1-202ENST00000418601 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
GTPBP1-202ENST00000418601 BAG6P46379 1132 aa29.58■■■□□ 2.33
GTPBP1-202ENST00000418601 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.56■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.56■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.53■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF1AQ12756 1690 aa29.53■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 VPS72Q15906 364 aa29.52■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 NAIPQ13075 1403 aa29.52■■■□□ 2.32
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.5■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 NUTM2FA1L443 756 aa29.5■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCA3Q99758 1704 aa29.5■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.49■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 A0A0G2JS52 829 aa29.48■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 MYT1Q01538 1121 aa29.48■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.46■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 PPLO60437 1756 aa29.46■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
GTPBP1-202ENST00000418601 YY1P25490 414 aa29.43■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.43■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 NRAPQ86VF7 1730 aa29.41■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHG5O94827 1062 aa29.4■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 ITGAEP38570 1179 aa29.4■■■□□ 2.3
GTPBP1-202ENST00000418601 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.38■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.37■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.36■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 DISP2A7MBM2 1401 aa29.36■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 TECPR2O15040 1411 aa29.36■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRB2O60241 1585 aa29.35■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.34■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.33■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 IFT172Q9UG01 1749 aa29.33■■■□□ 2.29
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM182BQ5T319 152 aa29.31■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.3■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 STK26Q9P289 416 aa29.3■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.28■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF10O15013 1369 aa29.27■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.27■■■□□ 2.28
GTPBP1-202ENST00000418601 PSME1Q06323 249 aa29.26■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM83GA6ND36 823 aa29.25■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 SBNO1A3KN83 1393 aa29.25■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.23■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 BTG4Q9NY30 223 aa29.22■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.22■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 RREB1Q92766 1687 aa29.21■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC11Q96J66 1382 aa29.2■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.19■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.19■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.17■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.15■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.15■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.15■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.14■■■□□ 2.26
GTPBP1-202ENST00000418601 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM37O94972 964 aa29.12■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 ALS2Q96Q42 1657 aa29.12■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.1■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.1■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.09■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 APBA3O96018 575 aa29.09■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.09■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 PIK3C2GO75747 1445 aa29.08■■■□□ 2.25
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.06■■■□□ 2.24
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