RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 APAF1O14727 1248 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-7P63135 1459 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NEFMP07197 916 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAR3O75815 825 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 AGLP35573 1532 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRB1O14514 1584 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYM3Q14202 1370 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS3P49796 1198 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-202ENST00000417536 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC24A1O60721 1099 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PSI1 815 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A3P48751 1232 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM161AQ3B820 660 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 REREQ9P2R6 1566 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf34Q49A92 452 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CABP2Q9NPB3 220 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 USP35Q9P2H5 1018 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAM1Q96QH2 718 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 NEUROD2Q15784 382 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 WWC1Q8IX03 1113 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MORC1Q86VD1 984 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 POGKQ9P215 609 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHDP01880 384 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 NGEFQ8N5V2 710 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PANK1Q8TE04 598 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 COG6Q9Y2V7 657 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TNRQ92752 1358 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE3AQ14432 1141 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ALKQ9UM73 1620 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 NFKBIBQ15653 356 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRMP28827 1452 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RUNDC1Q96C34 613 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SHPRHQ149N8 1683 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 EVC2Q86UK5 1308 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFYVE9O95405 1425 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 METP08581 1390 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 MTHFSP49914 203 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 LTKP29376 864 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1-202ENST00000417536 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 IL27Q8NEV9 243 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM2FA1L443 756 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNQ9UQP3 1299 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP53Q96M91 514 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK19Q9BWU1 502 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.96■■□□□ 1.43
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