RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DLC1Q96QB1 1528 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAM1Q96QH2 718 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MST1RQ04912 1400 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.92■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POGKQ9P215 609 aa24.92■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.91■■□□□ 1.58
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.88■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.87■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRINP3Q76B58 766 aa24.86■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POTEAQ6S8J7 498 aa24.84■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHLPP1O60346 1717 aa24.83■■□□□ 1.57
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.81■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRB2O60241 1585 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUTM2FA1L443 756 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JCADQ9P266 1359 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ORAI2Q96SN7 254 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.71■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.71■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.71■■□□□ 1.55
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRP6O75581 1613 aa24.68■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.68■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.68■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHPRHQ149N8 1683 aa24.66■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.65■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.65■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXO3O43524 673 aa24.64■■□□□ 1.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF1AQ12756 1690 aa24.64■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDK19Q9BWU1 502 aa24.63■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.62■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.62■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP32Q8NFA0 1604 aa24.61■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP7BP35670 1465 aa24.6■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PXDNQ92626 1479 aa24.59■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.57■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EVC2Q86UK5 1308 aa24.57■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.56■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.55■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.54■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.54■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSME1Q06323 249 aa24.53■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CABP2Q9NPB3 220 aa24.53■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITSN1Q15811 1721 aa24.52■■□□□ 1.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP47Q96K76 1375 aa24.5■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SBNO1A3KN83 1393 aa24.49■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.49■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.48■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.48■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.48■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.47■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.47■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.45■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC24A1O60721 1099 aa24.45■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACEP12821 1306 aa24.44■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF10O15013 1369 aa24.43■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.42■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TESK2Q96S53 571 aa24.42■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CABP1Q9NZU7 370 aa24.42■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RXRBP28702 533 aa24.39■■□□□ 1.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AFF2P51816 1311 aa24.37■■□□□ 1.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTS2O95450 1211 aa24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms