RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 LAMC1P11047 1609 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRC-206ENST00000413409 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRC-206ENST00000413409 E9PCH4 1651 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRC-206ENST00000413409 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRC-206ENST00000413409 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRC-206ENST00000413409 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRC-206ENST00000413409 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRC-206ENST00000413409 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRC-206ENST00000413409 LRP5O75197 1615 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRC-206ENST00000413409 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRC-206ENST00000413409 MYOM2P54296 1465 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRC-206ENST00000413409 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRC-206ENST00000413409 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PTPRC-206ENST00000413409 GLI3P10071 1580 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRC-206ENST00000413409 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRC-206ENST00000413409 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRC-206ENST00000413409 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 PXDNQ92626 1479 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 NUP155O75694 1391 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRC-206ENST00000413409 SLIT2O94813 1529 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 FOXO3O43524 673 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRC-206ENST00000413409 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRC-206ENST00000413409 TONSLQ96HA7 1378 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRC-206ENST00000413409 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRC-206ENST00000413409 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRC-206ENST00000413409 NEUROD1Q13562 356 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRC-206ENST00000413409 VPS72Q15906 364 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRC-206ENST00000413409 BAG6P46379 1132 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 CLTCL1P53675 1640 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 NUTM2FA1L443 756 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 USP32Q8NFA0 1604 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PTPRC-206ENST00000413409 YY1P25490 414 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHG5O94827 1062 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 FAM182BQ5T319 152 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRC-206ENST00000413409 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 KIF1BO60333 1816 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0G2JS52 829 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 FAM83GA6ND36 823 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 MYT1Q01538 1121 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRC-206ENST00000413409 DISP2A7MBM2 1401 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 STK26Q9P289 416 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 TECPR2O15040 1411 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 KIF1AQ12756 1690 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 ABCA3Q99758 1704 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRC-206ENST00000413409 NRAPQ86VF7 1730 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 PPLO60437 1756 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 BTG4Q9NY30 223 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 PSME1Q06323 249 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 SBNO1A3KN83 1393 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 MIER1Q8N108 512 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC11Q96J66 1382 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 TRIM37O94972 964 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF10O15013 1369 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRC-206ENST00000413409 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms