RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
CSNK1E-204ENST00000403904 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
CSNK1E-204ENST00000403904 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
CSNK1E-204ENST00000403904 C14orf37Q86TY3 774 aa46.79■■■■■ 5.08
CSNK1E-204ENST00000403904 NALCNQ8IZF0 1738 aa46.77■■■■■ 5.08
CSNK1E-204ENST00000403904 TESK2Q96S53 571 aa46.76■■■■■ 5.08
CSNK1E-204ENST00000403904 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa46.74■■■■■ 5.07
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa46.73■■■■■ 5.07
CSNK1E-204ENST00000403904 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa46.71■■■■■ 5.07
CSNK1E-204ENST00000403904 C19orf44Q9H6X5 657 aa46.66■■■■■ 5.06
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRB2O60241 1585 aa46.65■■■■■ 5.06
CSNK1E-204ENST00000403904 MSH6P52701 1360 aa46.62■■■■■ 5.05
CSNK1E-204ENST00000403904 TULP4Q9NRJ4 1543 aa46.61■■■■■ 5.05
CSNK1E-204ENST00000403904 WASLO00401 505 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
CSNK1E-204ENST00000403904 EVC2Q86UK5 1308 aa46.58■■■■■ 5.05
CSNK1E-204ENST00000403904 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa46.58■■■■■ 5.05
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC24A1O60721 1099 aa46.57■■■■■ 5.05
CSNK1E-204ENST00000403904 TMF1P82094 1093 aa46.56■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 CDK19Q9BWU1 502 aa46.56■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 DISP3Q9P2K9 1392 aa46.56■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 ATF3P18847 181 aa46.52■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 DCCP43146 1447 aa46.52■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 CERKQ8TCT0 537 aa46.52■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 NUTM2FA1L443 756 aa46.51■■■■■ 5.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 CABP2Q9NPB3 220 aa46.51■■■■■ 5.04
CSNK1E-204ENST00000403904 FMN2Q9NZ56 1722 aa46.49■■■■■ 5.03
CSNK1E-204ENST00000403904 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
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CSNK1E-204ENST00000403904 IQSEC2Q5JU85 1478 aa46.41■■■■■ 5.02
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CSNK1E-204ENST00000403904 PRR36Q9H6K5 1346 aa46.39■■■■■ 5.02
CSNK1E-204ENST00000403904 USP32Q8NFA0 1604 aa46.39■■■■■ 5.02
CSNK1E-204ENST00000403904 CDCA8Q53HL2 280 aa46.39■■■■■ 5.02
CSNK1E-204ENST00000403904 MST1RQ04912 1400 aa46.38■■■■■ 5.01
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CSNK1E-204ENST00000403904 ATP7BP35670 1465 aa46.36■■■■■ 5.01
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF7Q2M1P5 1343 aa46.34■■■■■ 5.01
CSNK1E-204ENST00000403904 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
CSNK1E-204ENST00000403904 ANKARQ7Z5J8 1434 aa46.33■■■■■ 5.01
CSNK1E-204ENST00000403904 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.32■■■■■ 5.01
CSNK1E-204ENST00000403904 SLAIN2Q9P270 581 aa46.32■■■■■ 5.01
CSNK1E-204ENST00000403904 WASHC2AQ641Q2 1341 aa46.3■■■■■ 5
CSNK1E-204ENST00000403904 ATAD2Q6PL18 1390 aa46.3■■■■■ 5
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CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
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CSNK1E-204ENST00000403904 ESCO1Q5FWF5 840 aa46.25■■■■■ 4.99
CSNK1E-204ENST00000403904 ORAI2Q96SN7 254 aa46.25■■■■■ 4.99
CSNK1E-204ENST00000403904 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa46.25■■■■■ 4.99
CSNK1E-204ENST00000403904 ITSN1Q15811 1721 aa46.25■■■■■ 4.99
CSNK1E-204ENST00000403904 UBAP1LF5GYI3 381 aa46.24■■■■■ 4.99
CSNK1E-204ENST00000403904 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa46.23■■■■■ 4.99
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CSNK1E-204ENST00000403904 CABP1Q9NZU7 370 aa46.22■■■■■ 4.99
CSNK1E-204ENST00000403904 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa46.18■■■■■ 4.98
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa46.18■■■■■ 4.98
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CSNK1E-204ENST00000403904 PLEKHG3A1L390 1219 aa46.12■■■■■ 4.97
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CSNK1E-204ENST00000403904 NINLQ9Y2I6 1382 aa46.1■■■■■ 4.97
CSNK1E-204ENST00000403904 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa46.08■■■■■ 4.97
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CSNK1E-204ENST00000403904 CD163L1Q9NR16 1453 aa46.02■■■■■ 4.96
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CSNK1E-204ENST00000403904 A0A1W2PP64 1363 aa45.98■■■■■ 4.95
CSNK1E-204ENST00000403904 AKAP12Q02952 1782 aa45.97■■■■■ 4.95
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CSNK1E-204ENST00000403904 PSME1Q06323 249 aa45.93■■■■■ 4.94
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CSNK1E-204ENST00000403904 KRT28Q7Z3Y7 464 aa45.87■■■■■ 4.93
CSNK1E-204ENST00000403904 CARD14Q9BXL6 1004 aa45.86■■■■■ 4.93
CSNK1E-204ENST00000403904 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP45.82■■■■■ 4.93
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CSNK1E-204ENST00000403904 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
CSNK1E-204ENST00000403904 NSD3Q9BZ95 1437 aa45.78■■■■■ 4.92
CSNK1E-204ENST00000403904 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
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CSNK1E-204ENST00000403904 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
CSNK1E-204ENST00000403904 SSH2Q76I76 1423 aa45.77■■■■■ 4.92
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