RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399208.6

SETD4-205, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-205ENST00000399208 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.2■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 ATRNO75882 1429 aa22.2■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 PPLO60437 1756 aa22.2■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.19■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 FOXD1Q16676 465 aa22.18■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.16■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 MYOM2P54296 1465 aa22.16■■□□□ 1.14
SETD4-205ENST00000399208 PXDNQ92626 1479 aa22.14■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 FOXO3O43524 673 aa22.13■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.13■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.13■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 CCDC125Q86Z20 511 aa22.12■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.12■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SETD4-205ENST00000399208 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.09■■□□□ 1.13
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SETD4-205ENST00000399208 STK26Q9P289 416 aa22.09■■□□□ 1.13
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SETD4-205ENST00000399208 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.02■■□□□ 1.12
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SETD4-205ENST00000399208 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.01■■□□□ 1.11
SETD4-205ENST00000399208 IFT172Q9UG01 1749 aa22.01■■□□□ 1.11
SETD4-205ENST00000399208 KIF1AQ12756 1690 aa22.01■■□□□ 1.11
SETD4-205ENST00000399208 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22■■□□□ 1.11
SETD4-205ENST00000399208 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.99■■□□□ 1.11
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SETD4-205ENST00000399208 PIK3C2GO75747 1445 aa21.98■■□□□ 1.11
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SETD4-205ENST00000399208 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.96■■□□□ 1.11
SETD4-205ENST00000399208 PSME1Q06323 249 aa21.95■■□□□ 1.1
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SETD4-205ENST00000399208 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.94■■□□□ 1.1
SETD4-205ENST00000399208 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.93■■□□□ 1.1
SETD4-205ENST00000399208 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.93■■□□□ 1.1
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SETD4-205ENST00000399208 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.89■■□□□ 1.09
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SETD4-205ENST00000399208 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.87■■□□□ 1.09
SETD4-205ENST00000399208 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.87■■□□□ 1.09
SETD4-205ENST00000399208 PLEKHG5O94827 1062 aa21.86■■□□□ 1.09
SETD4-205ENST00000399208 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.86■■□□□ 1.09
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SETD4-205ENST00000399208 PRAM1Q96QH2 718 aa21.84■■□□□ 1.09
SETD4-205ENST00000399208 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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SETD4-205ENST00000399208 FAM83GA6ND36 823 aa21.82■■□□□ 1.08
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SETD4-205ENST00000399208 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.81■■□□□ 1.08
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SETD4-205ENST00000399208 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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SETD4-205ENST00000399208 ADGRB1O14514 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
SETD4-205ENST00000399208 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SETD4-205ENST00000399208 HRCP23327 699 aa21.69■■□□□ 1.06
SETD4-205ENST00000399208 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.69■■□□□ 1.06
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