RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POGKQ9P215 609 aa21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.83■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MST1RQ04912 1400 aa21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.75■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.74■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRINP3Q76B58 766 aa21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.73■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPA1LP34931 641 aa21.72■■□□□ 1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRB2O60241 1585 aa21.7■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORAI2Q96SN7 254 aa21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.64■■□□□ 1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC24A1O60721 1099 aa21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTM2FA1L443 756 aa21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK19Q9BWU1 502 aa21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EVC2Q86UK5 1308 aa21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP47Q96K76 1375 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JCADQ9P266 1359 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXO3O43524 673 aa21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP7BP35670 1465 aa21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.54■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSME1Q06323 249 aa21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TESK2Q96S53 571 aa21.52■■□□□ 1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CABP2Q9NPB3 220 aa21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.5■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF1AQ12756 1690 aa21.49■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PXDNQ92626 1479 aa21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP32Q8NFA0 1604 aa21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SBNO1A3KN83 1393 aa21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHLPP1O60346 1717 aa21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMF1P82094 1093 aa21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDCA8Q53HL2 280 aa21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CABP1Q9NZU7 370 aa21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACEP12821 1306 aa21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF10O15013 1369 aa21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITSN1Q15811 1721 aa21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHPRHQ149N8 1683 aa21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP6P35125 1406 aa21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMC1Q8TDI8 760 aa21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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