RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 PRAM1Q96QH2 718 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 NUCB2P80303 420 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 TEFQ10587 303 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 GCC1Q96CN9 775 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRN2-201ENST00000389413 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAK2O60296 914 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 MRE11P49959 708 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 NECTIN2Q92692 538 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 GORABQ5T7V8 394 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 SKAP1Q86WV1 359 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 CABP1Q9NZU7 370 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 CDK19Q9BWU1 502 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 MCTP1Q6DN14 999 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 ATAD2Q6PL18 1390 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF3AQ9Y496 699 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRN2-201ENST00000389413 IL27Q8NEV9 243 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF428Q96B54 188 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 FCHSD2O94868 740 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 RABEP1Q15276 862 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 ARID3AQ99856 593 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 GNAI3P08754 354 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 NPHP1O15259 732 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 TPM4P67936 248 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 RAPGEF3O95398 923 aa19.64■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.74
PTPRN2-201ENST00000389413 H3BQV1 296 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 IFFO2Q5TF58 517 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP10BO94823 1461 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR62O43379 1518 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM184AQ8NB25 1140 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 NLRP6P59044 892 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 ERC2O15083 957 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 SMC3Q9UQE7 1217 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 MCM4P33991 863 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 NFE2L2Q16236 605 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC4A2P04920 1241 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRN2-201ENST00000389413 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms