RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369123.3

LIN28B-AS1-201, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIN28B-AS1, Length 575 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.59■■□□□ 1.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.58■■□□□ 1.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 POGKQ9P215 609 aa24.58■■□□□ 1.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.57■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRAM1Q96QH2 718 aa24.57■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.57■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.56■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.54■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ORAI2Q96SN7 254 aa24.52■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ADGRB2O60241 1585 aa24.51■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SHPRHQ149N8 1683 aa24.51■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NEUROD1Q13562 356 aa24.51■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.51■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.51■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.5■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.48■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KIF1AQ12756 1690 aa24.45■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.44■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.42■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TONSLQ96HA7 1378 aa24.42■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FOXO3O43524 673 aa24.4■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.4■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.4■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUTM2FA1L443 756 aa24.39■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.39■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.38■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PXDNQ92626 1479 aa24.38■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PSME1Q06323 249 aa24.36■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ILDR2Q71H61 639 aa24.36■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.36■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.34■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LRP6O75581 1613 aa24.33■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 USP32Q8NFA0 1604 aa24.33■■□□□ 1.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.32■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.32■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SBNO1A3KN83 1393 aa24.31■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.31■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.31■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CDK19Q9BWU1 502 aa24.3■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.3■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.29■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ITSN1Q15811 1721 aa24.27■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ATP7BP35670 1465 aa24.27■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.26■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SOCS7O14512 581 aa24.25■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.25■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ARHGEF10O15013 1369 aa24.25■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.25■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.24■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.23■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.23■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.22■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 EVC2Q86UK5 1308 aa24.22■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SLC24A1O60721 1099 aa24.21■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 POTEAQ6S8J7 498 aa24.21■■□□□ 1.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.18■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 AFF2P51816 1311 aa24.17■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NGLY1Q96IV0 654 aa24.17■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ADAMTS2O95450 1211 aa24.16■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 C8orf37Q96NL8 207 aa24.16■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ACEP12821 1306 aa24.13■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CABP2Q9NPB3 220 aa24.13■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ALS2Q96Q42 1657 aa24.12■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.12■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.11■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RXRBP28702 533 aa24.1■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms