RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
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PTPRK-201ENST00000368202 NWD1Q149M9 1564 aa16.84■□□□□ 0.29
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PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.82■□□□□ 0.28
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PTPRK-201ENST00000368202 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-201ENST00000368202 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-201ENST00000368202 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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PTPRK-201ENST00000368202 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PP64 1363 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-201ENST00000368202 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-201ENST00000368202 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-201ENST00000368202 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-201ENST00000368202 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRK-201ENST00000368202 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRK-201ENST00000368202 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MST1RQ04912 1400 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRK-201ENST00000368202 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-201ENST00000368202 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-201ENST00000368202 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 CCER2I3L3R5 266 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 USP6P35125 1406 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 MORC1Q86VD1 984 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 PSME1Q06323 249 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-201ENST00000368202 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.48■□□□□ 0.23
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