RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 ADGRL1O94910 1474 aa24.26■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 NGEFQ8N5V2 710 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 MORC1Q86VD1 984 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 ADGRB3O60242 1522 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 NLRP1Q9C000 1473 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 RLBP1P12271 317 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.22■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 SLC24A1O60721 1099 aa24.22■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.21■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.21■■□□□ 1.47
CITED2-201ENST00000367651 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.2■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.2■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 RUNDC1Q96C34 613 aa24.2■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.2■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.19■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 ADGRB1O14514 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.17■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 PPLO60437 1756 aa24.17■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 MTHFSP49914 203 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED2-201ENST00000367651 ASXL2Q76L83 1435 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 USP32Q8NFA0 1604 aa24.13■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 NPATQ14207 1427 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 WDR63Q8IWG1 891 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CITED2-201ENST00000367651 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 CCDC27Q2M243 656 aa24.06■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 POGKQ9P215 609 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 GLI2P10070 1586 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 ADGRB2O60241 1585 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 BECN1Q14457 450 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 CFAP53Q96M91 514 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 GGT6Q6P531 493 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CITED2-201ENST00000367651 AAMPQ13685 434 aa24.01■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 CABP2Q9NPB3 220 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.99■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.98■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 ZMYM3Q14202 1370 aa23.98■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 CD109Q6YHK3 1445 aa23.97■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 ABCC3O15438 1527 aa23.96■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.96■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 EVC2Q86UK5 1308 aa23.95■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.95■■□□□ 1.43
CITED2-201ENST00000367651 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 NSD2O96028 1365 aa23.93■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.93■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.93■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.93■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.93■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 A0A1W2PP64 1363 aa23.92■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 TRIM27P14373 513 aa23.92■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.92■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.91■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.91■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.91■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.91■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.9■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 PIK3C2BO00750 1634 aa23.9■■□□□ 1.42
CITED2-201ENST00000367651 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 ABCC11Q96J66 1382 aa23.88■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.88■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.86■■□□□ 1.41
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