RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366472.5

SH3BP5L-201, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5L, Length 3,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP5L-201ENST00000366472 GRPEL1Q9HAV7 217 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP5L-201ENST00000366472 GBP4Q96PP9 640 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP5L-201ENST00000366472 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
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SH3BP5L-201ENST00000366472 ANTXR1Q9H6X2 564 aa17.78■□□□□ 0.44
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SH3BP5L-201ENST00000366472 CABP2Q9NPB3 220 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP5L-201ENST00000366472 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP5L-201ENST00000366472 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 ABCC1P33527 1531 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 HMOX1P09601 288 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP5L-201ENST00000366472 ZNF521Q96K83 1311 aa17.73■□□□□ 0.43
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