RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 SIRT1Q96EB6 747 aa21.61■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 PRAM1Q96QH2 718 aa21.6■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.6■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.6■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.59■■□□□ 1.05
CSAG1-201ENST00000361211 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.58■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.57■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.56■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 ORAI2Q96SN7 254 aa21.56■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.55■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 NUTM2FA1L443 756 aa21.55■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 POGKQ9P215 609 aa21.54■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRB2O60241 1585 aa21.53■■□□□ 1.04
CSAG1-201ENST00000361211 JCADQ9P266 1359 aa21.51■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.51■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.48■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.48■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 TONSLQ96HA7 1378 aa21.48■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 SHPRHQ149N8 1683 aa21.47■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 USP32Q8NFA0 1604 aa21.46■■□□□ 1.03
CSAG1-201ENST00000361211 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 LRP6O75581 1613 aa21.43■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 KIF1AQ12756 1690 aa21.42■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 PXDNQ92626 1479 aa21.42■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 FOXO3O43524 673 aa21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.4■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.39■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 ILDR2Q71H61 639 aa21.39■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.38■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.38■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.38■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.37■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 ATP7BP35670 1465 aa21.36■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.35■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 CDK19Q9BWU1 502 aa21.34■■□□□ 1.01
CSAG1-201ENST00000361211 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.32■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.31■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.31■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.3■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 ITSN1Q15811 1721 aa21.29■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.29■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.27■■□□□ 1
CSAG1-201ENST00000361211 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 CABP2Q9NPB3 220 aa21.26■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 PSME1Q06323 249 aa21.25■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 SBNO1A3KN83 1393 aa21.24■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 POTEAQ6S8J7 498 aa21.24■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS2O95450 1211 aa21.23■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.22■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 EVC2Q86UK5 1308 aa21.21■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.21■□□□□ 0.99
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf37Q96NL8 207 aa21.2■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.2■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 ALS2Q96Q42 1657 aa21.2■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.2■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.19■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 ACEP12821 1306 aa21.19■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 AFF2P51816 1311 aa21.19■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.18■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF10O15013 1369 aa21.18■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA3Q99758 1704 aa21.18■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHG5O94827 1062 aa21.17■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.16■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 CABP1Q9NZU7 370 aa21.15■□□□□ 0.98
CSAG1-201ENST00000361211 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CSAG1-201ENST00000361211 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.13■□□□□ 0.97
CSAG1-201ENST00000361211 NGLY1Q96IV0 654 aa21.13■□□□□ 0.97
CSAG1-201ENST00000361211 USP47Q96K76 1375 aa21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms