RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359276.8

CTPS2-201, Transcript of CTP synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS2, Length 3,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2-201ENST00000359276 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 NGEFQ8N5V2 710 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 JPH4Q96JJ6 628 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.43■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 OFD1O75665 1012 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 AAMPQ13685 434 aa20.42■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 TRIM27P14373 513 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.41■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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CTPS2-201ENST00000359276 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.4■□□□□ 0.86
CTPS2-201ENST00000359276 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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CTPS2-201ENST00000359276 A2MP01023 1474 aa20.38■□□□□ 0.85
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CTPS2-201ENST00000359276 WDR63Q8IWG1 891 aa20.36■□□□□ 0.85
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CTPS2-201ENST00000359276 MAP7D2Q96T17 732 aa20.35■□□□□ 0.85
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CTPS2-201ENST00000359276 NLRP1Q9C000 1473 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTPS2-201ENST00000359276 SYCE3A1L190 88 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS2-201ENST00000359276 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS2-201ENST00000359276 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.33■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 RBSNQ9H1K0 784 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 ADGRL2O95490 1459 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 PIK3C2GO75747 1445 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 SNX21Q969T3 373 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 TSC1Q92574 1164 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 FAM177BA6PVY3 158 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS2-201ENST00000359276 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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CTPS2-201ENST00000359276 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTPS2-201ENST00000359276 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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CTPS2-201ENST00000359276 KIF16BQ96L93 1317 aa20.27■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.27■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 NUCB1Q02818 461 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 E9PCH4 1651 aa20.25■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.24■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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CTPS2-201ENST00000359276 ST18O60284 1047 aa20.23■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 CASC1Q6TDU7 716 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 SLC24A1O60721 1099 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 DISP1Q96F81 1524 aa20.22■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 PLA2R1Q13018 1463 aa20.21■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 CEP170Q5SW79 1584 aa20.21■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.21■□□□□ 0.83
CTPS2-201ENST00000359276 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.21■□□□□ 0.83
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CTPS2-201ENST00000359276 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 DYNC1I1O14576 645 aa20.2■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 KIF3BO15066 747 aa20.19■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.19■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 RABEP1Q15276 862 aa20.19■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.19■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 STK26Q9P289 416 aa20.18■□□□□ 0.82
CTPS2-201ENST00000359276 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.17■□□□□ 0.82
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